31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0902 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  51.62 
 
 
904 aa  823    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  100 
 
 
879 aa  1785    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  97.84 
 
 
879 aa  1723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  98.98 
 
 
879 aa  1769    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  81.49 
 
 
945 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  74.58 
 
 
945 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  28.63 
 
 
893 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  27.26 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  27.26 
 
 
541 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  29.05 
 
 
834 aa  129  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  29.14 
 
 
541 aa  128  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  28.89 
 
 
541 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  31.55 
 
 
966 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  31.37 
 
 
925 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  32.26 
 
 
838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  28.21 
 
 
632 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  27.34 
 
 
899 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.54 
 
 
575 aa  101  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  29.79 
 
 
885 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  29.65 
 
 
911 aa  94  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  32.38 
 
 
550 aa  88.6  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  29.6 
 
 
1058 aa  82  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  30.49 
 
 
1072 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  29.06 
 
 
291 aa  72  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  28.46 
 
 
1033 aa  68.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  30.37 
 
 
1047 aa  68.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  29.9 
 
 
245 aa  67.4  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  29.84 
 
 
1058 aa  67  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  31.05 
 
 
1062 aa  67  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  29.27 
 
 
1080 aa  65.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  27.23 
 
 
799 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>