17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4122 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  100 
 
 		 899 aa  1806    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  33.11 
 
 		 966 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  34.15 
 
 		 925 aa  365  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  30.12 
 
 		 893 aa  308  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  30.19 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  30.19 
 
 		 541 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  30.19 
 
 		 541 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  29.95 
 
 		 541 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  27.9 
 
 		 904 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  27.34 
 
 		 879 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  28.99 
 
 		 879 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  29.28 
 
 		 879 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  27.37 
 
 		 834 aa  97.8  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  27.51 
 
 		 632 aa  97.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  28.77 
 
 		 838 aa  93.2  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  25.62 
 
 		 885 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.28 
 
 		 575 aa  76.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>