17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0306 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
575 aa  1191    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  24.01 
 
 
879 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  23.54 
 
 
879 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  24.24 
 
 
879 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  25.76 
 
 
904 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4122  hypothetical protein  25.28 
 
 
899 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.412369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2424  hypothetical protein  25.91 
 
 
966 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.660613  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  25.99 
 
 
838 aa  70.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4251  hypothetical protein  24.34 
 
 
541 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1063  hypothetical protein  24.79 
 
 
925 aa  70.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  23.31 
 
 
834 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2485  hypothetical protein  23.86 
 
 
541 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3843  hypothetical protein  24.1 
 
 
541 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5075  hypothetical protein  24.1 
 
 
541 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1157  hypothetical protein  23.85 
 
 
893 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1919  hypothetical protein  23.35 
 
 
632 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  25.63 
 
 
885 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>