19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3701 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3711  hypothetical protein  72.84 
 
 
556 aa  867    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3701  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1152    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3672  hypothetical protein  69.6 
 
 
556 aa  826    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3643  hypothetical protein  69.24 
 
 
556 aa  822    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0919274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3618  hypothetical protein  68.71 
 
 
556 aa  818    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2673  hypothetical protein  82.47 
 
 
559 aa  969    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4786  zinc finger CHC2-family protein  43.18 
 
 
899 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000150755  normal  0.630286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  28.24 
 
 
1086 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  28.24 
 
 
1086 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1923  zinc finger CHC2-family protein  30.92 
 
 
1118 aa  150  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  30.64 
 
 
1084 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  24.14 
 
 
759 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  23.12 
 
 
741 aa  80.9  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1807  hypothetical protein  22.28 
 
 
690 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000440945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  24.86 
 
 
1080 aa  67.4  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  23.91 
 
 
1062 aa  53.9  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  27.1 
 
 
1058 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0704  hypothetical protein  24.42 
 
 
645 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.164472  normal  0.0179361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  23.37 
 
 
1072 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>