30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1046 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  302  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  47.56 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  35.62 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  47.56 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  41.67 
 
 		 867 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  43.53 
 
 		 718 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  39.13 
 
 		 868 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  39.13 
 
 		 868 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  39.13 
 
 		 868 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  44.78 
 
 		 741 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  57.14 
 
 		 759 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  45.61 
 
 		 895 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  43.94 
 
 		 815 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  46.67 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  42.17 
 
 		 798 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  49.15 
 
 		 312 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  50 
 
 		 725 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  48.28 
 
 		 309 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  46.3 
 
 		 1776 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  47.83 
 
 		 880 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  55.81 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  43.75 
 
 		 293 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2005  hypothetical protein  35.62 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.598822  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3582  hypothetical protein  31.08 
 
 		 494 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000410159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  55.26 
 
 		 696 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  44 
 
 		 283 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  44.9 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  50 
 
 		 684 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  31.11 
 
 		 572 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  32.47 
 
 		 554 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>