49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0232 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  100 
 
 
292 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  47.12 
 
 
293 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  36.42 
 
 
296 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  31.19 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  36.97 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  33.09 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  29.69 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  29.51 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  28.68 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  28.52 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  34.98 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.46 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  31.84 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  34.31 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  30.88 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  32.84 
 
 
343 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  30.53 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  34.98 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  32.16 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  33.83 
 
 
342 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  30.05 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  27.13 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  33.17 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  32.27 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  31.55 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  32.66 
 
 
352 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  37.14 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  32.85 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  33.03 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  35.03 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  33.08 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  32.34 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  28.89 
 
 
336 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  31 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  24.18 
 
 
341 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  29.48 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  31.5 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  33.5 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  29.2 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  28.25 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  33.98 
 
 
353 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  32.84 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  31.86 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  32 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  32.32 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  29.35 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  29.65 
 
 
347 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0830067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>