56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5356 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  594  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  56.46 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  28.84 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  34.39 
 
 
575 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  30.28 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  30.14 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  27.99 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  37.5 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  30.21 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  26.45 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  30.5 
 
 
348 aa  62.4  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  31.39 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  31.5 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  29.52 
 
 
665 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  29.9 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  28.64 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  25 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  31.71 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  28.17 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  27.52 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  29.8 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  27.97 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  29.92 
 
 
345 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  29.9 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  25.86 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  30.73 
 
 
348 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  29.26 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  24.31 
 
 
309 aa  55.8  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  29.29 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  24.91 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  30.15 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  30.43 
 
 
350 aa  53.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  30.07 
 
 
359 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  29.13 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  29.13 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  34.62 
 
 
346 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  31.22 
 
 
351 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  30.5 
 
 
347 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  28.77 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  27.88 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  30.15 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  30.5 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  28.77 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  28.51 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  34.81 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  26.5 
 
 
380 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  30.73 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  34.51 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  28.68 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  28.11 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  27.11 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  28.5 
 
 
353 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  26.32 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>