97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3166 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  100 
 
 		 665 aa  1341    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1486  ATPase  46.61 
 
 		 796 aa  300  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.616225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  46.55 
 
 		 389 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  40.71 
 
 		 621 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  49.81 
 
 		 299 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  41.58 
 
 		 320 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  34.27 
 
 		 465 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  32.74 
 
 		 667 aa  86.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  34.71 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  63.49 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  54.88 
 
 		 930 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  32.51 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  29.74 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  31.02 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  32.24 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  32.77 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.18 
 
 		 731 aa  67  0.0000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  34.48 
 
 		 348 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  31.65 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  31.65 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  27.87 
 
 		 654 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  29.44 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  34.07 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  31.96 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  31.07 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  28.04 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  33.5 
 
 		 343 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  26.05 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  37.93 
 
 		 345 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  31.73 
 
 		 345 aa  62  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  32.68 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  29.57 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  32.02 
 
 		 351 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  30.73 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  32.43 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  30.54 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  35.59 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  33.12 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  28.46 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  24.42 
 
 		 841 aa  58.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3667  hypothetical protein  30.21 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  34.19 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  28.77 
 
 		 344 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 336 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  26.5 
 
 		 720 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  34.19 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  34.19 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  34.19 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  32.83 
 
 		 342 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  34.96 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  29.3 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  28.28 
 
 		 298 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  31.21 
 
 		 339 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.56 
 
 		 279 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  25.82 
 
 		 445 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  24.76 
 
 		 743 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  31.28 
 
 		 354 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  30.67 
 
 		 353 aa  54.3  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  25.68 
 
 		 575 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  28.22 
 
 		 357 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  31.97 
 
 		 401 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  31.18 
 
 		 336 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  31.43 
 
 		 346 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  27.39 
 
 		 283 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  28.5 
 
 		 679 aa  52  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  24.1 
 
 		 718 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  29.88 
 
 		 350 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1994  hypothetical protein  27.93 
 
 		 404 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  30.56 
 
 		 353 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  25.64 
 
 		 299 aa  51.2  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  25.14 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 334 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  29.55 
 
 		 345 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  32.84 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  29.41 
 
 		 512 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  25.14 
 
 		 719 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.23 
 
 		 681 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.23 
 
 		 681 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  30.21 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0355  hypothetical protein  28.79 
 
 		 255 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0426919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4150  hypothetical protein  27.04 
 
 		 382 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2513  hypothetical protein  23.6 
 
 		 536 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  28.69 
 
 		 421 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  26.97 
 
 		 354 aa  46.6  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0060  hypothetical protein  32.67 
 
 		 368 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  27.54 
 
 		 294 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  22.25 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  27.03 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1283  AAA ATPase  26.18 
 
 		 392 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261303  normal  0.841625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  29.78 
 
 		 276 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  26.38 
 
 		 387 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  28.38 
 
 		 412 aa  44.3  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  24.9 
 
 		 728 aa  44.3  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  32.39 
 
 		 309 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  30.43 
 
 		 375 aa  43.9  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  43.9  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>