82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2130 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  47.81 
 
 		 848 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  45.62 
 
 		 746 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  46.55 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  45.35 
 
 		 813 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  43.07 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  42.09 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  36.95 
 
 		 778 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  39.7 
 
 		 818 aa  168  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  39.03 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  35.4 
 
 		 782 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  33.1 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  45.96 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  50.31 
 
 		 797 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  36.67 
 
 		 950 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  31.48 
 
 		 833 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  34.04 
 
 		 1448 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1448 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  40.13 
 
 		 955 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.33 
 
 		 986 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  32.75 
 
 		 739 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.68 
 
 		 953 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  31.68 
 
 		 744 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  38.16 
 
 		 958 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  38.16 
 
 		 958 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  31.91 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.09 
 
 		 953 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1580 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  36.51 
 
 		 955 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  36.51 
 
 		 950 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  32.38 
 
 		 1255 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  33.1 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  29.63 
 
 		 430 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  32.98 
 
 		 621 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  28.77 
 
 		 408 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  36.1 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  32.2 
 
 		 736 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1077 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  30.74 
 
 		 1557 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1495 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  31.75 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  30.48 
 
 		 523 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  38.32 
 
 		 890 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  30.37 
 
 		 1389 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  28.46 
 
 		 357 aa  95.5  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  28.46 
 
 		 411 aa  95.5  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  37.72 
 
 		 890 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  34.09 
 
 		 895 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.98 
 
 		 681 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.55 
 
 		 678 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  33.11 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  38.1 
 
 		 899 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  33.94 
 
 		 681 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  40.94 
 
 		 763 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  40.94 
 
 		 763 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  32.43 
 
 		 775 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  37.68 
 
 		 896 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  40.94 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  36.99 
 
 		 878 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  32.37 
 
 		 835 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  37.31 
 
 		 777 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  37.31 
 
 		 777 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  36.84 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  39.58 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  37.32 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  28.26 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  35.42 
 
 		 776 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  28.65 
 
 		 621 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  27.11 
 
 		 644 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  35.07 
 
 		 929 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  26.67 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  30.05 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  30.05 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  29.51 
 
 		 615 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  31.14 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  38.37 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  24.86 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  41.76 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  29.29 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  23.51 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>