66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3324 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1241    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  99.84 
 
 
615 aa  1238    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  54.64 
 
 
637 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  53.86 
 
 
644 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  98.86 
 
 
615 aa  1224    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  49.53 
 
 
620 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  51.21 
 
 
621 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  55.36 
 
 
621 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  35.65 
 
 
950 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  36.36 
 
 
955 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  37.76 
 
 
955 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.31 
 
 
958 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  35.31 
 
 
958 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  37.43 
 
 
950 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  35.24 
 
 
953 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  34.31 
 
 
797 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.54 
 
 
953 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  30.04 
 
 
818 aa  91.3  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  32.27 
 
 
368 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  35.34 
 
 
778 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  28.49 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  36 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  31.55 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  30.92 
 
 
1557 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  33.02 
 
 
848 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  30.6 
 
 
782 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  31.38 
 
 
1389 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  32.09 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  31.64 
 
 
813 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  29.33 
 
 
278 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  30.8 
 
 
777 aa  64.7  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  27.19 
 
 
338 aa  64.7  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  31.05 
 
 
1255 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  28.34 
 
 
775 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  30.05 
 
 
277 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  28.25 
 
 
777 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  31.72 
 
 
739 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  29.71 
 
 
297 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  27.81 
 
 
775 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  32.05 
 
 
354 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  35.44 
 
 
736 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  27.8 
 
 
303 aa  53.9  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  32.05 
 
 
621 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  28.8 
 
 
776 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  25.84 
 
 
272 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  35.29 
 
 
777 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  35.29 
 
 
777 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  31.91 
 
 
744 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  35.29 
 
 
777 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  38.1 
 
 
332 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.78 
 
 
681 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  25.71 
 
 
890 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6335  hypothetical protein  27.45 
 
 
208 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  29.58 
 
 
777 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  31.82 
 
 
666 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  25.77 
 
 
986 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  25.71 
 
 
890 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  30.67 
 
 
1287 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.91 
 
 
681 aa  47.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  35.71 
 
 
751 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  31.11 
 
 
326 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.48 
 
 
1495 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  28.99 
 
 
736 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  29.63 
 
 
1580 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  26.7 
 
 
1448 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  26.7 
 
 
1448 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>