61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0611 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  100 
 
 		 430 aa  878    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  39.17 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  39.91 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  42.69 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  27.67 
 
 		 1389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  28.57 
 
 		 1255 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  28.47 
 
 		 986 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  27.43 
 
 		 1557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1580 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1077 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  28.23 
 
 		 1448 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1448 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  29.63 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  23.46 
 
 		 621 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  27.46 
 
 		 272 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  27.54 
 
 		 746 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  27.63 
 
 		 848 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  25.77 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  28.41 
 
 		 782 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  26.45 
 
 		 813 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  25.14 
 
 		 778 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1495 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  26.33 
 
 		 744 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  27.67 
 
 		 275 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  26.71 
 
 		 818 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  25.28 
 
 		 357 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  28.45 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  26.33 
 
 		 739 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  25.76 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  25.8 
 
 		 736 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  23.1 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  24.55 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  28.91 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  25.85 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  25.77 
 
 		 271 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  25.65 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  26.36 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  25 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  26.22 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  27.62 
 
 		 958 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  27.62 
 
 		 958 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  23.69 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  27.62 
 
 		 953 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  26.78 
 
 		 953 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  28.16 
 
 		 890 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  28.16 
 
 		 890 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.54 
 
 		 681 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  26.97 
 
 		 878 aa  53.9  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.09 
 
 		 678 aa  53.5  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  24.89 
 
 		 899 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  23.63 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  25 
 
 		 681 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  28.57 
 
 		 895 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  27.5 
 
 		 896 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  25.42 
 
 		 955 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  26.32 
 
 		 775 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  25.42 
 
 		 950 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  50 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  26.32 
 
 		 775 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  26.19 
 
 		 777 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>