72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6494 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  66.88 
 
 		 620 aa  768    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  100 
 
 		 621 aa  1249    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  63.8 
 
 		 621 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  56.21 
 
 		 644 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  55.68 
 
 		 637 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  50.84 
 
 		 615 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  50.67 
 
 		 615 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  50.67 
 
 		 615 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  35.78 
 
 		 950 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  36.39 
 
 		 955 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.53 
 
 		 955 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  36.55 
 
 		 950 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.82 
 
 		 958 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  35.82 
 
 		 958 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  33.24 
 
 		 797 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  36.63 
 
 		 953 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  35.42 
 
 		 953 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  31.84 
 
 		 818 aa  101  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  36.47 
 
 		 778 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  29.46 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  31.82 
 
 		 782 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 848 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  33.64 
 
 		 746 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  30.57 
 
 		 275 aa  80.5  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  37.93 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  37.93 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  36.67 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  32.35 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  28.1 
 
 		 277 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  28.19 
 
 		 1389 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  31.74 
 
 		 986 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1495 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  28.16 
 
 		 1557 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  37.99 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  35.46 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  28.46 
 
 		 1255 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  31.84 
 
 		 775 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  26.09 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  28.89 
 
 		 890 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  28.99 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1580 aa  67  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  28.64 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  35.2 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  30.48 
 
 		 736 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  27.56 
 
 		 890 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  29.07 
 
 		 777 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  27.48 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  29.72 
 
 		 272 aa  62  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  33.13 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  27.5 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  34.94 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  26.23 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.26 
 
 		 1448 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  35.37 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1448 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  28.8 
 
 		 777 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  32.29 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  28.8 
 
 		 777 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  24.51 
 
 		 357 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  24.51 
 
 		 411 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  28.63 
 
 		 777 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  27.42 
 
 		 297 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  28.68 
 
 		 776 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1077 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  29.89 
 
 		 523 aa  51.2  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  27.64 
 
 		 895 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6335  hypothetical protein  26.53 
 
 		 208 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  32.58 
 
 		 1287 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  36.9 
 
 		 751 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  21.31 
 
 		 408 aa  43.9  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  34.12 
 
 		 899 aa  43.9  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>