85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0668 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  100 
 
 		 833 aa  1746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  30.6 
 
 		 920 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  34.69 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  32.69 
 
 		 744 aa  151  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  31.59 
 
 		 739 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  34.81 
 
 		 736 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  38.12 
 
 		 813 aa  125  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  31.48 
 
 		 277 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  30.56 
 
 		 275 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.56 
 
 		 986 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  30.41 
 
 		 746 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  29.87 
 
 		 848 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  29.02 
 
 		 778 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  29.18 
 
 		 896 aa  105  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  31.19 
 
 		 272 aa  105  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  24.78 
 
 		 835 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  29.96 
 
 		 278 aa  103  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  33.46 
 
 		 338 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1580 aa  101  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  31.3 
 
 		 950 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  26.46 
 
 		 1255 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.81 
 
 		 1448 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1448 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  29.89 
 
 		 818 aa  96.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  32.57 
 
 		 955 aa  95.5  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  35.56 
 
 		 953 aa  95.1  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.15 
 
 		 953 aa  94.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  33.08 
 
 		 782 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  33.88 
 
 		 368 aa  93.2  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.05 
 
 		 958 aa  90.9  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.05 
 
 		 958 aa  90.9  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  31.53 
 
 		 271 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  33.49 
 
 		 297 aa  89  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  33.77 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  31.97 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  33.77 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  25.54 
 
 		 820 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  26.68 
 
 		 411 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  27.06 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  28.29 
 
 		 724 aa  82  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1495 aa  81.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  27.62 
 
 		 825 aa  81.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  27.89 
 
 		 689 aa  80.5  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  25.57 
 
 		 756 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  25.28 
 
 		 846 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  29.49 
 
 		 751 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  28.85 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1077 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  36.72 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  35.17 
 
 		 955 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  35.17 
 
 		 950 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  29.91 
 
 		 1557 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  35.94 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  30.77 
 
 		 797 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  30.04 
 
 		 1389 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  24.74 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  29.35 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  26.94 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  30.43 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  24.66 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  29.8 
 
 		 890 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  29.8 
 
 		 890 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  30.68 
 
 		 777 aa  63.9  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  32.86 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  31.07 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  25 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  30.52 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  32.86 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  33.59 
 
 		 128 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.1 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  31.47 
 
 		 776 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.81 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.4 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  30.81 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  29.28 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.63 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  30.81 
 
 		 763 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  33.58 
 
 		 303 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  25.86 
 
 		 895 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  25.23 
 
 		 899 aa  56.6  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  23.88 
 
 		 444 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  44.83 
 
 		 697 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  24.73 
 
 		 878 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3668  integrase family protein  31.62 
 
 		 269 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  32.14 
 
 		 777 aa  45.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>