16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2603 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1069    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  29.38 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  26.87 
 
 		 813 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  31.71 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  28.49 
 
 		 542 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00297  hypothetical protein  23.45 
 
 		 701 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  22.53 
 
 		 866 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  25.48 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  26.64 
 
 		 422 aa  87.4  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  22.51 
 
 		 848 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  25.57 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3216  hypothetical protein  26.09 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000265804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  43.33 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 		 637 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  23.77 
 
 		 1287 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  36.25 
 
 		 770 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>