37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5574 on replicon NC_011730
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  100 
 
 		 1287 aa  2653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  39.86 
 
 		 305 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  31.9 
 
 		 332 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  25.11 
 
 		 947 aa  102  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  29.17 
 
 		 866 aa  75.5  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  27.09 
 
 		 422 aa  70.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  40.79 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  49.32 
 
 		 741 aa  62  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  36.07 
 
 		 695 aa  62  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  34.4 
 
 		 751 aa  61.6  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  34.88 
 
 		 797 aa  55.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.71 
 
 		 955 aa  53.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  39.19 
 
 		 958 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  22.83 
 
 		 848 aa  53.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  39.19 
 
 		 958 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  23.04 
 
 		 458 aa  52.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  34.52 
 
 		 953 aa  52.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.84 
 
 		 953 aa  52.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  34.52 
 
 		 955 aa  52.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  34.52 
 
 		 950 aa  52.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  37.84 
 
 		 950 aa  52  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  33 
 
 		 620 aa  51.6  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68475  predicted protein  40.45 
 
 		 782 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  27.42 
 
 		 263 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  33.72 
 
 		 621 aa  49.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  32.58 
 
 		 621 aa  48.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  35.71 
 
 		 736 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  23.24 
 
 		 458 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  43.48 
 
 		 734 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  28.8 
 
 		 765 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5262  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1336 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219671  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  30.67 
 
 		 615 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  30.67 
 
 		 615 aa  47.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  28.57 
 
 		 749 aa  46.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  28.35 
 
 		 1941 aa  46.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  27.42 
 
 		 263 aa  46.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2616  hypothetical protein  29.6 
 
 		 142 aa  45.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000844217  normal  0.47419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>