11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3238 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  100 
 
 
947 aa  1976    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  25.47 
 
 
848 aa  86.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  24.73 
 
 
1287 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  31.16 
 
 
422 aa  67.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  25.99 
 
 
458 aa  63.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  28.12 
 
 
697 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  22.5 
 
 
866 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  28.57 
 
 
662 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  26.15 
 
 
902 aa  56.6  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  23.11 
 
 
813 aa  53.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  24.66 
 
 
741 aa  44.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>