33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3304 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  100 
 
 		 741 aa  1538    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  47.37 
 
 		 1287 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  25.99 
 
 		 679 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  28.25 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  27.68 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  26.63 
 
 		 647 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  41.49 
 
 		 695 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  37.18 
 
 		 305 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  26.4 
 
 		 590 aa  54.3  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  42.47 
 
 		 332 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  26.95 
 
 		 642 aa  53.5  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  25.27 
 
 		 407 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  23.77 
 
 		 421 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  26.84 
 
 		 370 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1360  hypothetical protein  26.59 
 
 		 362 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182349  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.14 
 
 		 681 aa  48.5  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.2 
 
 		 681 aa  48.5  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  28.16 
 
 		 751 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2129  ATPase-like protein  26.18 
 
 		 465 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  35.96 
 
 		 734 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  24.67 
 
 		 395 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1577  bacteriophage P4 DNA primease  25.41 
 
 		 466 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190049  hitchhiker  0.000349117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0127  ATPase-like protein  24.73 
 
 		 389 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  26.38 
 
 		 358 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  34.18 
 
 		 765 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  36.9 
 
 		 309 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2616  AAA ATPase  27.23 
 
 		 674 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  26.27 
 
 		 797 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  22.58 
 
 		 621 aa  44.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  22.11 
 
 		 452 aa  44.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  24.66 
 
 		 947 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.74 
 
 		 678 aa  44.3  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  27.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>