More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3240 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  100 
 
 		 452 aa  883    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  45.78 
 
 		 647 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  46.46 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  46.22 
 
 		 647 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  45.35 
 
 		 607 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  45.85 
 
 		 617 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.71 
 
 		 614 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.75 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 604 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  35.68 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  37.44 
 
 		 586 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  43.4 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  37.85 
 
 		 571 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  37.95 
 
 		 609 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.2 
 
 		 604 aa  247  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  39.39 
 
 		 641 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.41 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  39.39 
 
 		 641 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.27 
 
 		 598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.27 
 
 		 598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  40.15 
 
 		 642 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.41 
 
 		 611 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  40 
 
 		 625 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  37.59 
 
 		 576 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  38.16 
 
 		 574 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  38.16 
 
 		 574 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  38.16 
 
 		 574 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  38.16 
 
 		 574 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  33.77 
 
 		 586 aa  243  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  34.64 
 
 		 576 aa  242  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  38.42 
 
 		 574 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.2 
 
 		 571 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.18 
 
 		 585 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.41 
 
 		 652 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.37 
 
 		 600 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  38.16 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  36.92 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  38.42 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.06 
 
 		 588 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.63 
 
 		 605 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  41.35 
 
 		 629 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.79 
 
 		 656 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  38.16 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  33.84 
 
 		 573 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  37.89 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.92 
 
 		 576 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  36.83 
 
 		 588 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  37.1 
 
 		 575 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.66 
 
 		 663 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  38.42 
 
 		 574 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  35.12 
 
 		 622 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  35.48 
 
 		 622 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.94 
 
 		 651 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  36.38 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  35.48 
 
 		 622 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  36.38 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.18 
 
 		 592 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.28 
 
 		 660 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.41 
 
 		 655 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  38.5 
 
 		 575 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.56 
 
 		 660 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.53 
 
 		 660 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  40.05 
 
 		 629 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  41.16 
 
 		 621 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  34.63 
 
 		 584 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  36.97 
 
 		 624 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  36.02 
 
 		 636 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.76 
 
 		 598 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.02 
 
 		 660 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  36.16 
 
 		 800 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.85 
 
 		 598 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.55 
 
 		 664 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.26 
 
 		 582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  36.56 
 
 		 590 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.03 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  35.16 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  39.6 
 
 		 627 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  35.73 
 
 		 638 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  34.6 
 
 		 623 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.32 
 
 		 663 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  41.23 
 
 		 639 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.05 
 
 		 619 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  31.84 
 
 		 593 aa  233  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.23 
 
 		 600 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.75 
 
 		 599 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.56 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  39.27 
 
 		 606 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.86 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>