More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1138 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1138  DNA primase  100 
 
 		 454 aa  910    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  47.79 
 
 		 647 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  48.01 
 
 		 647 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  49.31 
 
 		 617 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  48.53 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  46.46 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.01 
 
 		 613 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.53 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.39 
 
 		 613 aa  253  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 604 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.4 
 
 		 583 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.65 
 
 		 611 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  41.77 
 
 		 646 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  41.77 
 
 		 646 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.28 
 
 		 605 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.37 
 
 		 582 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.59 
 
 		 587 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.99 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.81 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  34.06 
 
 		 640 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  33.12 
 
 		 674 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.14 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.67 
 
 		 605 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  30.89 
 
 		 653 aa  232  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  36.55 
 
 		 580 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  33.48 
 
 		 614 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.73 
 
 		 656 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  35.7 
 
 		 641 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  38.86 
 
 		 629 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  40.31 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.35 
 
 		 593 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.28 
 
 		 584 aa  229  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  37.3 
 
 		 642 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  35.47 
 
 		 641 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  36.24 
 
 		 576 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.34 
 
 		 675 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.25 
 
 		 601 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  32.89 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.96 
 
 		 660 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.46 
 
 		 660 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  34.96 
 
 		 660 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.73 
 
 		 660 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.36 
 
 		 676 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  41.95 
 
 		 640 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.91 
 
 		 694 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.11 
 
 		 582 aa  226  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.11 
 
 		 582 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.68 
 
 		 598 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.11 
 
 		 582 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.91 
 
 		 651 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  33.66 
 
 		 599 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.12 
 
 		 587 aa  226  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.38 
 
 		 576 aa  226  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.7 
 
 		 660 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  37.5 
 
 		 598 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.72 
 
 		 581 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.95 
 
 		 571 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.65 
 
 		 652 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  38.26 
 
 		 627 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  34.58 
 
 		 582 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  37.27 
 
 		 583 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.01 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  37.27 
 
 		 583 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  35.34 
 
 		 655 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  40.16 
 
 		 639 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  33.94 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.68 
 
 		 598 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  37.88 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  31.67 
 
 		 632 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.06 
 
 		 675 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  32.28 
 
 		 633 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.63 
 
 		 588 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  32.38 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.68 
 
 		 598 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.52 
 
 		 598 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.15 
 
 		 584 aa  222  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  35.01 
 
 		 599 aa  222  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  34.11 
 
 		 581 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.37 
 
 		 578 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  42.25 
 
 		 636 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  34.11 
 
 		 581 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.14 
 
 		 618 aa  222  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  34.46 
 
 		 577 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  34.11 
 
 		 581 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  34.11 
 
 		 581 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  34.11 
 
 		 581 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.03 
 
 		 600 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  31.75 
 
 		 640 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  34 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.53 
 
 		 619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.89 
 
 		 604 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  34.9 
 
 		 601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  33.49 
 
 		 578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  34.46 
 
 		 577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  34.58 
 
 		 584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>