More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1709 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  100 
 
 		 350 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0446  zinc finger, CHC2-family protein  31.88 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.417921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  25.78 
 
 		 588 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  25.97 
 
 		 655 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  28.27 
 
 		 614 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  26.19 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  24.72 
 
 		 594 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  23.24 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  21.26 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  24.86 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  22.84 
 
 		 609 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  23.81 
 
 		 626 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  25.23 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  23.88 
 
 		 623 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  25.67 
 
 		 666 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  24.85 
 
 		 600 aa  69.7  0.00000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  23.68 
 
 		 588 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  24.52 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  24.52 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  24.17 
 
 		 548 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  25.08 
 
 		 677 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  25.91 
 
 		 645 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  19.88 
 
 		 653 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  24.19 
 
 		 671 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  22.4 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  25.53 
 
 		 601 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  23.1 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  24.62 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  25.16 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  24.93 
 
 		 621 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  22.97 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  25.34 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  25.6 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  24.31 
 
 		 922 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  26.61 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  24.59 
 
 		 660 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  23.45 
 
 		 625 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  24.86 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4800  zinc finger, CHC2-family protein  39.39 
 
 		 2510 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0650684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  23.18 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  24.35 
 
 		 678 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  24.86 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  25.75 
 
 		 575 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  26.03 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  23.18 
 
 		 584 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  26.54 
 
 		 554 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  21.82 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  25.57 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  25.07 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  22.92 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  25.5 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  24.79 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  25.07 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  25 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  23.85 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  24.4 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  22.26 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  22.94 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  24.62 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  24.92 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  24.06 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  22.86 
 
 		 642 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  24.48 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  21.41 
 
 		 703 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  26.2 
 
 		 611 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  24.48 
 
 		 574 aa  59.7  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  24.35 
 
 		 629 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  24.62 
 
 		 574 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  23.78 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  25.34 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  22.11 
 
 		 577 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  22.46 
 
 		 641 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  23.33 
 
 		 617 aa  59.7  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  24.62 
 
 		 574 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  23.16 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  22.89 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  23.8 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  24.66 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  23.88 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  23.88 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  27.33 
 
 		 625 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3728  DNA primase  21.59 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  22.97 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  22.78 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2708  DNA primase  23.4 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  24.41 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  22.49 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  25.08 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  23.78 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  24.49 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  26.67 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  23.88 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  23.5 
 
 		 677 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  24.32 
 
 		 574 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  22.5 
 
 		 641 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  21.57 
 
 		 639 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  24.62 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  24.92 
 
 		 637 aa  57  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  24.32 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  23.4 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>