258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2260 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  100 
 
 		 922 aa  1912    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  25.71 
 
 		 614 aa  91.3  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  25.82 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  30.95 
 
 		 595 aa  80.1  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  25.8 
 
 		 600 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  23.42 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 604 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  27.69 
 
 		 583 aa  77.8  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  27.69 
 
 		 583 aa  77.8  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  21.33 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  26.94 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  23.39 
 
 		 587 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  26.76 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  26.65 
 
 		 599 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  26.61 
 
 		 576 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  25.83 
 
 		 573 aa  73.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  23.58 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  23.82 
 
 		 591 aa  73.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  23.71 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  23.35 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  23.35 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  24.86 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  23.35 
 
 		 574 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  23.58 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  25.08 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  26.8 
 
 		 581 aa  70.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  24.55 
 
 		 598 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  24.32 
 
 		 571 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  23.7 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  24.32 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  23.7 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  26.95 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  23.7 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  24.18 
 
 		 600 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  22.75 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  23.73 
 
 		 655 aa  68.6  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  23.42 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  24.56 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  23.51 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  21.26 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  22.71 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  26.13 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.8  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  26.13 
 
 		 581 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  27.41 
 
 		 605 aa  67.4  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  23.46 
 
 		 574 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  25.35 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  28.09 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  26.25 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  24.94 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  22.71 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  28.09 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  27.78 
 
 		 602 aa  63.9  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  28.83 
 
 		 544 aa  64.3  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  26.33 
 
 		 581 aa  63.9  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  25.63 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  25.35 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  24.77 
 
 		 350 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  27.65 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  24.72 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  25.2 
 
 		 604 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  26.22 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  21.79 
 
 		 621 aa  62  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  24.35 
 
 		 572 aa  62  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  22.75 
 
 		 576 aa  62  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  25.66 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  23.44 
 
 		 601 aa  61.6  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  24.29 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  23.92 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  24.31 
 
 		 673 aa  60.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  24.13 
 
 		 665 aa  60.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0314  DNA primase  26.16 
 
 		 604 aa  60.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  24.15 
 
 		 656 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  24.47 
 
 		 634 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  25.86 
 
 		 577 aa  60.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  26.07 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  26.6 
 
 		 576 aa  60.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  30.94 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  21.28 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  22.14 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0641  DNA primase  24.57 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  23.74 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  23.66 
 
 		 583 aa  59.3  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  21.96 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  23.74 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  25 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  23.74 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  23.13 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>