More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0795 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  63.73 
 
 		 554 aa  720    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  100 
 
 		 572 aa  1177    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  47.61 
 
 		 546 aa  518  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  44.88 
 
 		 548 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  45.79 
 
 		 595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  43.08 
 
 		 552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  40.97 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  50.12 
 
 		 605 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  50.12 
 
 		 614 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  50.12 
 
 		 605 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  38.58 
 
 		 564 aa  273  7e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.18 
 
 		 544 aa  262  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  33.02 
 
 		 592 aa  257  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  33.64 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  30.65 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  30.65 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  29.69 
 
 		 686 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.09 
 
 		 595 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  30.78 
 
 		 604 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  33.24 
 
 		 614 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  33.1 
 
 		 596 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  28.65 
 
 		 682 aa  243  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  29.16 
 
 		 598 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  29.7 
 
 		 675 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  37.28 
 
 		 594 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  34.9 
 
 		 617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.02 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  32.16 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  30.02 
 
 		 626 aa  240  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.33 
 
 		 613 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.2 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.12 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  30.93 
 
 		 590 aa  238  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  27.96 
 
 		 677 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.2 
 
 		 581 aa  236  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  38.11 
 
 		 576 aa  236  9e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.77 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  32.46 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  29.96 
 
 		 645 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  27.2 
 
 		 684 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  33.81 
 
 		 660 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  32.55 
 
 		 651 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  233  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.16 
 
 		 660 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.39 
 
 		 571 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.16 
 
 		 660 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.91 
 
 		 664 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.39 
 
 		 598 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  36.47 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  31.79 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  31.79 
 
 		 578 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.91 
 
 		 663 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.68 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.23 
 
 		 598 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.16 
 
 		 655 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.88 
 
 		 660 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.42 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.42 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.42 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.44 
 
 		 663 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.42 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.42 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.42 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  31.97 
 
 		 605 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  32.56 
 
 		 605 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  29.32 
 
 		 652 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  30 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.8 
 
 		 652 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.08 
 
 		 651 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  30.22 
 
 		 605 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  31.16 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  31.85 
 
 		 694 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.32 
 
 		 656 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  32.98 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  30.22 
 
 		 605 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  29.33 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  35.59 
 
 		 660 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  28.74 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  36.45 
 
 		 576 aa  227  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  29.83 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  32.19 
 
 		 573 aa  227  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.4 
 
 		 638 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  34.93 
 
 		 587 aa  227  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.23 
 
 		 601 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.16 
 
 		 581 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  31.66 
 
 		 579 aa  227  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.16 
 
 		 581 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  33.17 
 
 		 583 aa  227  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.49 
 
 		 588 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.29 
 
 		 587 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  29.96 
 
 		 609 aa  226  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  32.29 
 
 		 584 aa  226  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.48 
 
 		 575 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  32.98 
 
 		 584 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>