More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3141 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  79.41 
 
 		 204 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  77.45 
 
 		 204 aa  345  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  81.68 
 
 		 204 aa  339  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  80.63 
 
 		 204 aa  325  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 204 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 204 aa  288  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  66.84 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  66.84 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  66.84 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 205 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 205 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  60.3 
 
 		 205 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  63.74 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  63.19 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  61.26 
 
 		 205 aa  237  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 205 aa  231  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  59.89 
 
 		 205 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  57.75 
 
 		 205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  51.55 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  30.49 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  22.02 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.65 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  23.64 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.31 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  24.56 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>