More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5019 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 916 aa  1766    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.37 
 
 		 919 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 919 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.37 
 
 		 919 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 997 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 921 aa  231  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.31 
 
 		 921 aa  231  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.31 
 
 		 921 aa  231  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  39.37 
 
 		 900 aa  172  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  38.37 
 
 		 921 aa  170  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 918 aa  162  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  37.2 
 
 		 919 aa  160  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  34.68 
 
 		 922 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  36.39 
 
 		 929 aa  155  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 928 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 953 aa  147  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 923 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  37.46 
 
 		 913 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  34.67 
 
 		 955 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 927 aa  124  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 1064 aa  122  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 923 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 1052 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  33.87 
 
 		 930 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 928 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 889 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  32.15 
 
 		 892 aa  113  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  32.58 
 
 		 884 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 909 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 918 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  31.98 
 
 		 934 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.71 
 
 		 977 aa  110  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  31.11 
 
 		 923 aa  109  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  36.45 
 
 		 913 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  26.94 
 
 		 943 aa  107  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.22 
 
 		 998 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.83 
 
 		 925 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.24 
 
 		 929 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  32.48 
 
 		 961 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 927 aa  105  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 946 aa  104  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  33.24 
 
 		 884 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 995 aa  96.3  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 919 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 911 aa  94.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 905 aa  94.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 904 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 		 920 aa  93.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 950 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.99 
 
 		 954 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 940 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  34.72 
 
 		 240 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 1148 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 		 913 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 1000 aa  81.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 938 aa  80.9  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 		 946 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 992 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.87 
 
 		 927 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 915 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.99 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 1141 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 983 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.43 
 
 		 1146 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 1141 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 1141 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 1141 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  32 
 
 		 936 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 956 aa  74.7  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  33.54 
 
 		 872 aa  73.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 1015 aa  72.8  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.99 
 
 		 1006 aa  72.8  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.05 
 
 		 1429 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  34.12 
 
 		 919 aa  71.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  31.86 
 
 		 893 aa  71.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.02 
 
 		 1075 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 		 993 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 881 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 881 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 998 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 910 aa  68.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 876 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 967 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.94 
 
 		 923 aa  67  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  30.93 
 
 		 897 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  28.01 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  28.02 
 
 		 953 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  28.05 
 
 		 1101 aa  63.9  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 		 952 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.03 
 
 		 1163 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 970 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 907 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 960 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 973 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.67 
 
 		 1121 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 894 aa  62.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 		 951 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 908 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 895 aa  62  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 982 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>