More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3440 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  100 
 
 		 853 aa  1749    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  56.48 
 
 		 855 aa  986    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  55.46 
 
 		 848 aa  933    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  60.02 
 
 		 856 aa  1048    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  29.69 
 
 		 877 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  29.91 
 
 		 828 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  28.34 
 
 		 839 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  28.29 
 
 		 841 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  27.17 
 
 		 853 aa  339  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  29.61 
 
 		 843 aa  314  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  25.03 
 
 		 857 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  25.74 
 
 		 838 aa  216  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  25.15 
 
 		 831 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  25.28 
 
 		 828 aa  148  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  24.04 
 
 		 829 aa  137  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  23.68 
 
 		 814 aa  130  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  23.4 
 
 		 816 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  22.64 
 
 		 849 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  19.13 
 
 		 811 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  42.55 
 
 		 1014 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 		 1059 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  38.83 
 
 		 1028 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  42.59 
 
 		 1053 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  42.55 
 
 		 1064 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  35.59 
 
 		 933 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1064 aa  68.9  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1050 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1010 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  41.24 
 
 		 1068 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1099 aa  67.8  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1034 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1006 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  22.3 
 
 		 905 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  35.45 
 
 		 1047 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 1084 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1040 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1020 aa  64.3  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 789 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1104 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1217 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 971 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 989 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1023 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  36.7 
 
 		 1024 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 753 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 1144 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1085 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1027 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 957 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 1004 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  38.05 
 
 		 1043 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1066 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1047 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  39.08 
 
 		 1137 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1063 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1101 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 1116 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1188 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1006 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 979 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  34.91 
 
 		 1075 aa  61.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1043 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1038 aa  61.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32.71 
 
 		 1018 aa  60.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 824 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  41.3 
 
 		 1083 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 1083 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1056 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  35.19 
 
 		 1035 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 1081 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1003 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 861 aa  60.1  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 994 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  35.63 
 
 		 977 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1062 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1016 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1038 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1076 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1138 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1065 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1147 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  40.22 
 
 		 1025 aa  59.3  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1060 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  27.07 
 
 		 854 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  39.24 
 
 		 1023 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 976 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1074 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  35.51 
 
 		 1134 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1021 aa  58.9  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1082 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1125 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 1063 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1096 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 958 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 1001 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>