187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1394 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 393 aa  749    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  40.5 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  40.6 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  33.43 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  29.19 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  33.22 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  30.82 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.52 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  50.59 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  54.55 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  31.41 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  29.23 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.18 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  46.51 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  30.19 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  29.73 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  35.47 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.99 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  27.95 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.71 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  44.71 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  41.86 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  30.31 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  42.35 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  40.7 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  32.88 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  25.52 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  25.87 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  44.71 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  25.16 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  32.01 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  44.71 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  44.71 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  48.53 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  44.71 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  41.18 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  48.39 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  26.46 
 
 		 602 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  43.02 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 597 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 526 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  38.55 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  30.96 
 
 		 392 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  25.85 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  45.57 
 
 		 517 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 563 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  45.9 
 
 		 600 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 		 485 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  30.08 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 558 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.47 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  28.83 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.82 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  40.62 
 
 		 650 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  41.18 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 659 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  31.47 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  46.58 
 
 		 504 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  42.42 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  30.02 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  30.32 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.26 
 
 		 665 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  47.76 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  25.2 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  29.82 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  43.66 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  40.85 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  41.89 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 705 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  46.55 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.62 
 
 		 480 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  29.37 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  36.97 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  59.52 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  45.31 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.45 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>