284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0810 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 499 aa  1035    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  37.82 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.51 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  32.08 
 
 		 497 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.83 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 490 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 506 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.85 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.21 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  33.98 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.53 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 501 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  30.08 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 493 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  26.62 
 
 		 511 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 506 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.91 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.09 
 
 		 502 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 519 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 530 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 557 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  25.32 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.85 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 507 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 495 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 511 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 531 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 538 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 537 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  24.95 
 
 		 507 aa  93.2  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 503 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 537 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 582 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 491 aa  90.5  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 529 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.06 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 534 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 509 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 466 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 579 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 514 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 513 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>