More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0419 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  53.33 
 
 		 1177 aa  1156    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1190 aa  2399    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  48 
 
 		 1186 aa  1043    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  52.4 
 
 		 1178 aa  1121    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  46.77 
 
 		 1185 aa  1006    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  52.23 
 
 		 1179 aa  1142    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  32.55 
 
 		 1178 aa  615  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  31.49 
 
 		 1176 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.45 
 
 		 1187 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.44 
 
 		 1189 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1189 aa  489  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  30.55 
 
 		 1189 aa  489  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  32.62 
 
 		 1198 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1189 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  32.04 
 
 		 1176 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.3 
 
 		 1176 aa  483  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  30.84 
 
 		 1189 aa  479  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  30.75 
 
 		 1189 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  30.75 
 
 		 1189 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.92 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  30.85 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  30.75 
 
 		 1189 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  30.84 
 
 		 1189 aa  479  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.46 
 
 		 1175 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  32.11 
 
 		 1176 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 		 1187 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  32.16 
 
 		 1176 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1185 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.24 
 
 		 1185 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1199 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.22 
 
 		 1173 aa  459  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.85 
 
 		 1199 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.58 
 
 		 1199 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.65 
 
 		 1186 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  28.26 
 
 		 1148 aa  441  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  29.5 
 
 		 1187 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1176 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.9 
 
 		 1191 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.54 
 
 		 1185 aa  425  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1177 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  30.37 
 
 		 1187 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.23 
 
 		 1184 aa  389  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.02 
 
 		 1186 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.69 
 
 		 1179 aa  379  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34.79 
 
 		 1185 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  28.96 
 
 		 1177 aa  350  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  27.79 
 
 		 1168 aa  343  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 		 1171 aa  340  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.4 
 
 		 1167 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 		 1403 aa  338  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1198 aa  334  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1170 aa  326  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 		 1170 aa  323  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1152 aa  317  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.76 
 
 		 1164 aa  298  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 		 1190 aa  295  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1196 aa  283  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.71 
 
 		 1174 aa  281  7e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  23.78 
 
 		 1184 aa  280  8e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1153 aa  274  6e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1204 aa  264  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  46.94 
 
 		 1190 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  47.86 
 
 		 1190 aa  261  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.66 
 
 		 1174 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  47.95 
 
 		 1177 aa  250  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  28.25 
 
 		 1189 aa  248  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  31.5 
 
 		 1301 aa  248  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1188 aa  244  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  28.14 
 
 		 1205 aa  241  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  46.44 
 
 		 1185 aa  236  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  46.03 
 
 		 1185 aa  234  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  49.1 
 
 		 980 aa  233  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  30.08 
 
 		 1184 aa  233  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  23.61 
 
 		 1189 aa  233  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  30.76 
 
 		 1192 aa  233  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  24.7 
 
 		 1146 aa  231  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.93 
 
 		 1172 aa  230  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  44.3 
 
 		 1255 aa  228  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  28.06 
 
 		 1179 aa  228  6e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.86 
 
 		 1217 aa  226  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  22.7 
 
 		 1172 aa  226  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 		 1308 aa  225  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  24.66 
 
 		 1146 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1175 aa  221  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.07 
 
 		 1149 aa  221  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.21 
 
 		 1191 aa  220  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  41.53 
 
 		 1188 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  41.53 
 
 		 1188 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  36.67 
 
 		 1194 aa  218  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  37.41 
 
 		 1195 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  40 
 
 		 1183 aa  216  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.5 
 
 		 1208 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  37.08 
 
 		 1198 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  28.39 
 
 		 1189 aa  216  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  41.74 
 
 		 1194 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 		 1162 aa  214  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  39.43 
 
 		 1199 aa  214  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1181 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  37.1 
 
 		 1170 aa  213  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 		 1204 aa  211  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>