More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0065 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  864    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  68.47 
 
 
413 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  48.64 
 
 
406 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  43.14 
 
 
424 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  37.42 
 
 
486 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  35.84 
 
 
409 aa  229  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  31.21 
 
 
476 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  31.19 
 
 
410 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  28.4 
 
 
425 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  29.73 
 
 
412 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  26.93 
 
 
423 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.21 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  27.36 
 
 
389 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  26.5 
 
 
452 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  27.18 
 
 
441 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  27.27 
 
 
457 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  27.27 
 
 
457 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  26.39 
 
 
472 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  26.35 
 
 
479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  25.96 
 
 
440 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  27.71 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.99 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  27.63 
 
 
449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.22 
 
 
400 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  24.19 
 
 
515 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.2 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  25.53 
 
 
435 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.78 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.67 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.76 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  24.88 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.25 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  23.96 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  25 
 
 
486 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  28.22 
 
 
463 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.82 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.26 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  24.93 
 
 
396 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.78 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.02 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  26.34 
 
 
451 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0063  hypothetical protein  62.67 
 
 
72 aa  90.5  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.38 
 
 
405 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.27 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.83 
 
 
400 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.46 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  23.97 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  27.33 
 
 
400 aa  87  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  24.18 
 
 
505 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  24.18 
 
 
505 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.21 
 
 
443 aa  86.3  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  26.46 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.14 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  26.07 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.07 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.07 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.07 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  24.83 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.5 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.43 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  26.34 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.08 
 
 
400 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.65 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  25.33 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.5 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.01 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.17 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  24.87 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.07 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  22.6 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.6 
 
 
406 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.68 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  23.51 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  24.75 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  26.61 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  24.79 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  22.8 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.61 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.21 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.43 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.15 
 
 
449 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  23.15 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  24.93 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  25.33 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  25.33 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.21 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.34 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.16 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  26.78 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.27 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.56 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  24.81 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  23.96 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  24.58 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.71 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  22.49 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  23.22 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  21.87 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>