More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0305 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 786 aa  1579    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 793 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  40.6 
 
 		 864 aa  505  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 753 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 754 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 757 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  37.38 
 
 		 756 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  36.82 
 
 		 761 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 866 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 835 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 959 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 831 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 882 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 814 aa  237  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 798 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 798 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 798 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 798 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 798 aa  230  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  26.38 
 
 		 798 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 798 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 798 aa  227  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 836 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 923 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 870 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 812 aa  194  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 798 aa  184  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 879 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 875 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 838 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 769 aa  98.6  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 728 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 780 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 784 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 807 aa  88.2  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 720 aa  87.8  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 860 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 737 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 751 aa  84.7  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27.99 
 
 		 691 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 780 aa  80.9  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 764 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 		 747 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 777 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 779 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 730 aa  74.7  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 703 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 802 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 773 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 780 aa  71.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 786 aa  70.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 775 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 758 aa  70.5  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 688 aa  70.5  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 832 aa  67.8  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31 
 
 		 727 aa  67.8  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.14 
 
 		 718 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 769 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 792 aa  66.6  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 867 aa  64.3  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 777 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 822 aa  63.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  28.7 
 
 		 751 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 747 aa  63.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 755 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 743 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 634 aa  62  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>