More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1881 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 838 aa  1697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 		 875 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 798 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  35.38 
 
 		 798 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 798 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 798 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 798 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 798 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 798 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 814 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 882 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 798 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 836 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 812 aa  289  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 866 aa  171  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 798 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 793 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 835 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  25.04 
 
 		 959 aa  125  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 761 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 786 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 831 aa  118  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 757 aa  117  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 815 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 754 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 879 aa  115  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 864 aa  114  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 756 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 923 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 870 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  32.46 
 
 		 680 aa  75.5  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 782 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 757 aa  67.4  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 863 aa  64.7  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  28.02 
 
 		 705 aa  64.7  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  28.1 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  28.37 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.51 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.51 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 764 aa  61.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 806 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  29.36 
 
 		 744 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.6 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 792 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.51 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.8 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 777 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 767 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 730 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.22 
 
 		 1023 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 687 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 		 678 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 817 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  28.95 
 
 		 652 aa  56.6  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  29 
 
 		 777 aa  56.2  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  29.53 
 
 		 750 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 757 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 773 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 628 aa  55.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 790 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 804 aa  55.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 681 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03469  Outer membrane protein  24.44 
 
 		 760 aa  55.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 688 aa  55.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.99 
 
 		 638 aa  55.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 615 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 704 aa  55.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 853 aa  54.7  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 875 aa  54.3  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.7 
 
 		 613 aa  54.3  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 743 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 702 aa  54.3  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 714 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 673 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 627 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 617 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 803 aa  54.3  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 518 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  29.53 
 
 		 751 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.55 
 
 		 746 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  29.53 
 
 		 751 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 702 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  29.53 
 
 		 751 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  29.89 
 
 		 746 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.51 
 
 		 739 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  31.45 
 
 		 611 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 687 aa  53.5  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  27.03 
 
 		 732 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 		 631 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 840 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  30.23 
 
 		 656 aa  53.5  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 766 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 758 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>