More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02415 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  53.81 
 
 		 798 aa  843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  53.81 
 
 		 798 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  45.04 
 
 		 882 aa  671    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  53.81 
 
 		 798 aa  842    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 814 aa  1645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  53.56 
 
 		 798 aa  837    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  53.38 
 
 		 798 aa  828    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  53.38 
 
 		 798 aa  828    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  54.17 
 
 		 798 aa  821    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  53.38 
 
 		 798 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  41.43 
 
 		 836 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  41.79 
 
 		 812 aa  592  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  39.25 
 
 		 875 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 838 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 866 aa  293  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 835 aa  259  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 786 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 793 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  27.32 
 
 		 959 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 864 aa  222  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 754 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 757 aa  198  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 798 aa  174  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 870 aa  161  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 879 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 831 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 923 aa  140  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.35 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 680 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 		 708 aa  71.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  26.88 
 
 		 740 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.11 
 
 		 613 aa  67.8  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  32.93 
 
 		 638 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.52 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 704 aa  66.6  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 720 aa  66.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 655 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.26 
 
 		 646 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 597 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1004 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 781 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  31.22 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 		 711 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 764 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.46 
 
 		 728 aa  62.4  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 713 aa  62  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  29.44 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 789 aa  61.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 737 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 794 aa  60.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 621 aa  60.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  30.27 
 
 		 751 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.62 
 
 		 653 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.32 
 
 		 616 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 919 aa  60.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.94 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 700 aa  60.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 652 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  29.73 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  30.94 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.82 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.82 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  29.73 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.44 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  29.73 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 971 aa  59.3  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1000 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  29.73 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.98 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  25.75 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  33.33 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>