102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0977 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1542    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  64.12 
 
 		 756 aa  987    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  71.45 
 
 		 754 aa  1113    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  48.91 
 
 		 864 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  70.75 
 
 		 753 aa  1110    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  60.86 
 
 		 761 aa  953    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 786 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 793 aa  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 866 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 798 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 798 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  28.08 
 
 		 798 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 798 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 798 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 798 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 798 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 835 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 882 aa  232  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 798 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 836 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  24.41 
 
 		 959 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 812 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 814 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 831 aa  181  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 870 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 798 aa  154  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 875 aa  134  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 815 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 923 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 838 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 879 aa  107  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.17 
 
 		 914 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 718 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 708 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 702 aa  54.7  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 769 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 751 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28 
 
 		 631 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 749 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 777 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.33 
 
 		 631 aa  51.6  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 1013 aa  51.2  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 617 aa  50.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 738 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 764 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 823 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 757 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2142  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 1034 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0000142845  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 693 aa  49.3  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 701 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  20.49 
 
 		 692 aa  48.5  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  23.69 
 
 		 615 aa  47.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 733 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 681 aa  47.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 823 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 790 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  24.19 
 
 		 715 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0238  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 943 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 707 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  24.54 
 
 		 743 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 924 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 		 776 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  21.45 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 880 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 798 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 694 aa  45.8  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1883  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 682 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 730 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  19.59 
 
 		 694 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 964 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 728 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 758 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02502  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 809 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00256111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 797 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.15 
 
 		 703 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0889  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.33 
 
 		 992 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000114339  unclonable  0.0000000138215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  22.22 
 
 		 694 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 823 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3939  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 		 1017 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.49 
 
 		 631 aa  45.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 719 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 627 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 741 aa  45.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 728 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 705 aa  45.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  24.9 
 
 		 759 aa  45.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 798 aa  44.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 782 aa  44.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 985 aa  44.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  33.65 
 
 		 1109 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 781 aa  44.3  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 737 aa  44.3  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>