More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1484 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 831 aa  1692    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 793 aa  311  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 786 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  29.15 
 
 		 959 aa  277  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 835 aa  270  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 866 aa  257  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 923 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 870 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 864 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 757 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 753 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 754 aa  172  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 882 aa  166  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 798 aa  161  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 798 aa  161  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 798 aa  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 798 aa  160  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  28.28 
 
 		 798 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 798 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 798 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 798 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 815 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 798 aa  157  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  25.12 
 
 		 756 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 836 aa  142  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 761 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 814 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 812 aa  131  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 875 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 879 aa  112  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 838 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 757 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 772 aa  64.3  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 792 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.92 
 
 		 680 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 704 aa  62.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.31 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25.96 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 734 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.73 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 753 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.44 
 
 		 715 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 764 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 777 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 919 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 617 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  25.5 
 
 		 622 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.11 
 
 		 734 aa  55.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1013 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 627 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  25.25 
 
 		 627 aa  55.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  22.67 
 
 		 613 aa  55.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 705 aa  55.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 771 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.51 
 
 		 640 aa  55.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 751 aa  54.7  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 790 aa  54.7  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  27.73 
 
 		 641 aa  54.3  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 720 aa  54.3  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 743 aa  54.3  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 678 aa  54.7  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 668 aa  54.3  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 707 aa  54.3  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 707 aa  54.3  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 597 aa  53.9  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.97 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.97 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.97 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.97 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 729 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 854 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 761 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 807 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 764 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.97 
 
 		 650 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 806 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 713 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.26 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.13 
 
 		 631 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 718 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 758 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 771 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 742 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 681 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 762 aa  52  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.26 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 627 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  23.83 
 
 		 839 aa  52  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 628 aa  52  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 729 aa  52  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 918 aa  52  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 774 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  29.96 
 
 		 692 aa  51.6  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 681 aa  52  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 642 aa  52  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>