More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0064 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  93.61 
 
 		 798 aa  1514    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  93.48 
 
 		 798 aa  1513    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 		 798 aa  1516    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  47.78 
 
 		 882 aa  730    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 		 798 aa  1516    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  54.79 
 
 		 814 aa  819    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1623    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1623    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  82.85 
 
 		 798 aa  1331    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1623    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  42.55 
 
 		 836 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 812 aa  608  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 875 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 838 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 866 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 753 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 835 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 754 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 757 aa  250  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 786 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 793 aa  238  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  27.71 
 
 		 756 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 864 aa  220  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 798 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  25.25 
 
 		 959 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 923 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 831 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 870 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 815 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 879 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 753 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  29.03 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  29.03 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  29.03 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.88 
 
 		 745 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 		 747 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.88 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  28.57 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  28.57 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.39 
 
 		 718 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 778 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.84 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.14 
 
 		 747 aa  60.1  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.29 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.95 
 
 		 752 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.26 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.38 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 711 aa  58.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.65 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  27.7 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.2 
 
 		 620 aa  57.4  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  27.7 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.17 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 614 aa  57.4  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  27.7 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 698 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 705 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  25.45 
 
 		 751 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  25.45 
 
 		 751 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 613 aa  57  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  25.45 
 
 		 751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 729 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  25.45 
 
 		 751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  25.45 
 
 		 751 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 628 aa  55.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.15 
 
 		 631 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 615 aa  55.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.84 
 
 		 638 aa  55.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 697 aa  55.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 794 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 820 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 		 696 aa  54.7  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  22.48 
 
 		 740 aa  54.7  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 829 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 		 696 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 680 aa  54.7  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 713 aa  54.7  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 658 aa  54.7  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 699 aa  54.7  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.86 
 
 		 665 aa  54.3  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 702 aa  54.7  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 642 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  27.84 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 731 aa  54.3  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>