More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0068 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  99.25 
 
 		 798 aa  1613    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  53.69 
 
 		 814 aa  834    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  99.62 
 
 		 798 aa  1619    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  99.37 
 
 		 798 aa  1615    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  47.72 
 
 		 882 aa  734    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 		 798 aa  1516    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 		 798 aa  1516    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  83.23 
 
 		 798 aa  1333    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1623    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 		 798 aa  1516    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  42.57 
 
 		 836 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  43.39 
 
 		 812 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 875 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 838 aa  409  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 866 aa  313  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 753 aa  275  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 754 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 757 aa  257  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 835 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 756 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 786 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 793 aa  226  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 864 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  25.5 
 
 		 959 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 923 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 870 aa  177  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 831 aa  167  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 879 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 753 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.45 
 
 		 718 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.3 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 705 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 		 703 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 		 703 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 		 729 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.77 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  32.54 
 
 		 745 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.79 
 
 		 631 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 704 aa  60.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.68 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 703 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 790 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.46 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.41 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.41 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.17 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.97 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.2 
 
 		 620 aa  57  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  27.68 
 
 		 675 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 613 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  28.65 
 
 		 680 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 614 aa  56.6  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  29.71 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  30.77 
 
 		 752 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 711 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 702 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.64 
 
 		 665 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 680 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  31.95 
 
 		 747 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.76 
 
 		 665 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 617 aa  55.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.76 
 
 		 665 aa  55.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 		 751 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.74 
 
 		 653 aa  55.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 		 696 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 		 696 aa  55.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  26.47 
 
 		 670 aa  55.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 		 751 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 806 aa  55.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 697 aa  54.7  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 720 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 		 751 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 		 751 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 628 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 743 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 698 aa  54.3  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 		 751 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 698 aa  54.3  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 698 aa  54.3  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 763 aa  54.3  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.18 
 
 		 665 aa  54.3  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 731 aa  54.3  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 692 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 828 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 615 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>