More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04790 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 793 aa  1604    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 786 aa  557  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 864 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 761 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 757 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 753 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 754 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  32.83 
 
 		 756 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  30.9 
 
 		 959 aa  345  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 831 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 835 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 866 aa  293  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 882 aa  260  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 870 aa  251  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 798 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  0.0000000155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 798 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  0.0000416662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 798 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000235152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 798 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000121546  unclonable  0.000000000240632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 814 aa  225  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 798 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  27.64 
 
 		 798 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 798 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 798 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000018092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 836 aa  205  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 812 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000386767  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 875 aa  180  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 879 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 798 aa  164  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 815 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000617894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 838 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 923 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.6 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 634 aa  75.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 721 aa  72  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 764 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  28.35 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.98 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  22.15 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 780 aa  64.7  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 828 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.78 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 634 aa  64.3  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 		 623 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  21.82 
 
 		 828 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 773 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 753 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  29.84 
 
 		 713 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 720 aa  62.4  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  22.88 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  25.52 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.57 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 705 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  20.66 
 
 		 703 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  20.66 
 
 		 703 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 758 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.23 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 730 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.18 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  20.66 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 751 aa  58.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.16 
 
 		 691 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 778 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  20.88 
 
 		 729 aa  57.4  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 733 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.45 
 
 		 696 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 783 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  25.82 
 
 		 752 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 721 aa  57.4  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 795 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  27.57 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  27.57 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 642 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 724 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 710 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  27.57 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 753 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 764 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 655 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 758 aa  56.6  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 678 aa  57  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>