More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2783 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  84.21 
 
 		 2272 aa  728    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  78.2 
 
 		 2036 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  76.81 
 
 		 1842 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  80.05 
 
 		 1882 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  68.03 
 
 		 1120 aa  1177    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  67.16 
 
 		 2122 aa  747    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  100 
 
 		 2000 aa  3997    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  85.22 
 
 		 978 aa  729    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  83.37 
 
 		 1682 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  83.1 
 
 		 575 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  85.54 
 
 		 1969 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  83.73 
 
 		 1300 aa  551  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  81.82 
 
 		 1241 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  64.49 
 
 		 561 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  60.91 
 
 		 752 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  55.53 
 
 		 1094 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.55 
 
 		 1356 aa  411  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  82.79 
 
 		 547 aa  406  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  52.75 
 
 		 735 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  61.11 
 
 		 669 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  51.9 
 
 		 1667 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  61.98 
 
 		 685 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  61.38 
 
 		 679 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  61.49 
 
 		 859 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  61.79 
 
 		 713 aa  390  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  56.27 
 
 		 675 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  50.11 
 
 		 1361 aa  387  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.58 
 
 		 2554 aa  386  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  75.9 
 
 		 791 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.06 
 
 		 1862 aa  373  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  72.73 
 
 		 581 aa  370  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  49.53 
 
 		 963 aa  363  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  60.48 
 
 		 658 aa  362  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  74.09 
 
 		 551 aa  360  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.21 
 
 		 528 aa  353  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  44.51 
 
 		 1282 aa  353  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.41 
 
 		 530 aa  343  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.12 
 
 		 930 aa  333  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.56 
 
 		 941 aa  325  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  45.5 
 
 		 958 aa  315  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  63.41 
 
 		 615 aa  308  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.5 
 
 		 838 aa  301  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.86 
 
 		 1236 aa  297  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.39 
 
 		 460 aa  284  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  40.89 
 
 		 1528 aa  281  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.3 
 
 		 1667 aa  279  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  56.42 
 
 		 3295 aa  267  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  77.91 
 
 		 184 aa  266  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.29 
 
 		 1732 aa  263  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.51 
 
 		 910 aa  260  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.43 
 
 		 1387 aa  253  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.62 
 
 		 861 aa  235  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  38.57 
 
 		 1011 aa  232  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  55.75 
 
 		 560 aa  230  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  43.8 
 
 		 971 aa  228  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  67.7 
 
 		 644 aa  224  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.99 
 
 		 869 aa  223  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.3 
 
 		 1292 aa  218  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.46 
 
 		 930 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.19 
 
 		 1783 aa  214  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  36.15 
 
 		 2176 aa  209  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.44 
 
 		 802 aa  207  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.85 
 
 		 952 aa  206  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.18 
 
 		 840 aa  205  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  38.9 
 
 		 823 aa  203  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.72 
 
 		 870 aa  198  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  55.98 
 
 		 1328 aa  197  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.53 
 
 		 2552 aa  196  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40.11 
 
 		 719 aa  196  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.83 
 
 		 443 aa  194  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.41 
 
 		 1814 aa  192  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.14 
 
 		 845 aa  190  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.03 
 
 		 786 aa  189  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  38.12 
 
 		 929 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  44.17 
 
 		 819 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 		 777 aa  181  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.09 
 
 		 439 aa  179  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  34.59 
 
 		 821 aa  179  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  33.65 
 
 		 865 aa  178  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.83 
 
 		 8871 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.26 
 
 		 1531 aa  174  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.27 
 
 		 1189 aa  174  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.87 
 
 		 1380 aa  173  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  34.02 
 
 		 1987 aa  173  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.44 
 
 		 938 aa  171  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40.22 
 
 		 1095 aa  168  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.3 
 
 		 1620 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.07 
 
 		 519 aa  161  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.61 
 
 		 1606 aa  157  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  48.34 
 
 		 816 aa  153  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  50.27 
 
 		 996 aa  152  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  48.48 
 
 		 1001 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.61 
 
 		 1602 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  40 
 
 		 408 aa  151  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  45.81 
 
 		 500 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  32.09 
 
 		 734 aa  147  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  43.43 
 
 		 1931 aa  145  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  30.85 
 
 		 574 aa  145  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  38.93 
 
 		 586 aa  143  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  52.41 
 
 		 940 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>