251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1896 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  100 
 
 		 646 aa  1306    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  67.53 
 
 		 655 aa  665    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  63.79 
 
 		 623 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.9 
 
 		 1209 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  53.11 
 
 		 572 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  56.15 
 
 		 767 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.25 
 
 		 639 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  51.69 
 
 		 628 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  54.04 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  46.04 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.87 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  47.49 
 
 		 1128 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  51.72 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  50.69 
 
 		 791 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  50.78 
 
 		 605 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.68 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.79 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.1 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  46.62 
 
 		 743 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 		 620 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  47.38 
 
 		 589 aa  379  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  94.44 
 
 		 690 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  95.37 
 
 		 854 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  33.81 
 
 		 393 aa  194  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  35.46 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  60.78 
 
 		 990 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 		 846 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  35.78 
 
 		 609 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  41.95 
 
 		 942 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  50.47 
 
 		 785 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50.47 
 
 		 880 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  50 
 
 		 842 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 		 966 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  48.15 
 
 		 423 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.29 
 
 		 812 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  44.55 
 
 		 963 aa  101  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.98 
 
 		 979 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.44 
 
 		 998 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  50 
 
 		 420 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  45.87 
 
 		 875 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.46 
 
 		 469 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  50.43 
 
 		 598 aa  97.4  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.49 
 
 		 491 aa  94  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  46.6 
 
 		 432 aa  94  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  48.54 
 
 		 974 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  46.3 
 
 		 913 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  45.28 
 
 		 580 aa  92  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  45.71 
 
 		 488 aa  90.5  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  39.81 
 
 		 1055 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  39.29 
 
 		 669 aa  90.1  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  30.06 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 774 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 746 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  46.23 
 
 		 719 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  44.66 
 
 		 442 aa  88.2  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 934 aa  88.2  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  26.98 
 
 		 346 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  48.08 
 
 		 446 aa  86.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  28.76 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  37.89 
 
 		 694 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  44.86 
 
 		 597 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  43.69 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  27.62 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  45.1 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  26.91 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  46.6 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  29.23 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  39.02 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  44.23 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  43.4 
 
 		 727 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.46 
 
 		 984 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  39.81 
 
 		 894 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  41.9 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  40.2 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  25.89 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  42.31 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  26.7 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  45.56 
 
 		 938 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 		 854 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 744 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  37.76 
 
 		 794 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.16 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  40 
 
 		 1007 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  44.04 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  26.68 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  45.16 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  47.62 
 
 		 829 aa  77  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  39.42 
 
 		 633 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.22 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40.95 
 
 		 778 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  44.23 
 
 		 438 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 525 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  38.68 
 
 		 906 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  44.57 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.68 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  38.24 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  46.24 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>