178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4621 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  100 
 
 		 497 aa  1015    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  38.51 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 469 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  36.81 
 
 		 494 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  38.39 
 
 		 497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  35.92 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  55.47 
 
 		 436 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  54.89 
 
 		 618 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.93 
 
 		 466 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  44.37 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.18 
 
 		 507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 571 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.04 
 
 		 474 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  44.85 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 1139 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  45.11 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  42.54 
 
 		 691 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  44.53 
 
 		 430 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.72 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.98 
 
 		 495 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  41.98 
 
 		 560 aa  97.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.71 
 
 		 520 aa  96.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  36.03 
 
 		 569 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.32 
 
 		 507 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  39.39 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  35.97 
 
 		 1259 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.16 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  30.99 
 
 		 494 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  28.87 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  35.21 
 
 		 1567 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  36.17 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  35.04 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  36.09 
 
 		 957 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  36.22 
 
 		 884 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  32.35 
 
 		 789 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.56 
 
 		 514 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  37.32 
 
 		 943 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.94 
 
 		 1016 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1413 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.9 
 
 		 695 aa  80.1  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.08 
 
 		 2073 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.59 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.51 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  46.07 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  34.69 
 
 		 1187 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 		 933 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.35 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  32.26 
 
 		 1222 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  36.84 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.9 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.58 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  31.58 
 
 		 737 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.43 
 
 		 648 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.85 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  35 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  36.22 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  32.37 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  31.72 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 615 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.07 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  40 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 858 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  40 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  40 
 
 		 807 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  40 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  40 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.6 
 
 		 890 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  38.38 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  28.87 
 
 		 801 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  30.4 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.4 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  32.7 
 
 		 963 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  37.97 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.06 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  35.09 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  41.03 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  35.61 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  35.56 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  33.56 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  29.6 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.54 
 
 		 803 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  41.38 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.12 
 
 		 863 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  36.19 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  40.45 
 
 		 1148 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>