143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0809 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  94.67 
 
 		 211 aa  308  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  92.49 
 
 		 782 aa  308  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  92.9 
 
 		 782 aa  303  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  92.9 
 
 		 782 aa  303  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  89.94 
 
 		 832 aa  296  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  89.94 
 
 		 782 aa  295  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  88.17 
 
 		 782 aa  292  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  89.35 
 
 		 900 aa  292  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  65.64 
 
 		 835 aa  218  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  55.81 
 
 		 787 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  40.83 
 
 		 897 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  40.23 
 
 		 911 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  46.3 
 
 		 822 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  41.92 
 
 		 889 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 779 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  38.52 
 
 		 850 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  38.52 
 
 		 850 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  32.79 
 
 		 952 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  38.52 
 
 		 850 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  32.79 
 
 		 924 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  33.13 
 
 		 783 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  33.12 
 
 		 1057 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 1063 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 1057 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 1063 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  31.87 
 
 		 1063 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  39.13 
 
 		 871 aa  88.6  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  35.4 
 
 		 1284 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  34.19 
 
 		 1059 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  35.94 
 
 		 957 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 1074 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  34.75 
 
 		 843 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  31.21 
 
 		 1284 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.25 
 
 		 869 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  35.4 
 
 		 868 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 		 835 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  33.05 
 
 		 843 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 875 aa  80.9  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  32.3 
 
 		 792 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  34.9 
 
 		 837 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  33.13 
 
 		 771 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2501  hypothetical protein  88.64 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 892 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  26.88 
 
 		 895 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 		 895 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 		 895 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.14 
 
 		 923 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  32.2 
 
 		 852 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  32.58 
 
 		 941 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  36.11 
 
 		 885 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 		 853 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  23.75 
 
 		 850 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.25 
 
 		 891 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.89 
 
 		 958 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  30.33 
 
 		 895 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  31.4 
 
 		 822 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  35.83 
 
 		 826 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.87 
 
 		 853 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 910 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  35.25 
 
 		 911 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1019 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.57 
 
 		 842 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1019 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.35 
 
 		 853 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  31.3 
 
 		 912 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  33.56 
 
 		 918 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0014  hypothetical protein  37.8 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.515774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  32.43 
 
 		 846 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  33.04 
 
 		 845 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  27.68 
 
 		 920 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  29.05 
 
 		 885 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 		 847 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  30.43 
 
 		 1197 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  32.73 
 
 		 845 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 477 aa  65.1  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  27.98 
 
 		 865 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.25 
 
 		 968 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  35.71 
 
 		 895 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.85 
 
 		 898 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 961 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  33.62 
 
 		 843 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  26.52 
 
 		 907 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 612 aa  60.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  29.73 
 
 		 1114 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  28.83 
 
 		 780 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  28.48 
 
 		 1111 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1111 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 		 1111 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 		 1111 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  27.93 
 
 		 780 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 811 aa  57.4  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 1094 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 932 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 		 928 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  25.15 
 
 		 509 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.71 
 
 		 853 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.21 
 
 		 1048 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  25.49 
 
 		 1006 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  27.64 
 
 		 962 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>