More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1790 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  61.37 
 
 		 900 aa  919    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  61.51 
 
 		 832 aa  924    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  47.74 
 
 		 787 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  55.85 
 
 		 835 aa  859    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 792 aa  1648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  60.82 
 
 		 782 aa  913    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  61.37 
 
 		 782 aa  925    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  61.26 
 
 		 782 aa  930    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  61.53 
 
 		 782 aa  921    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  61.1 
 
 		 782 aa  928    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  37.36 
 
 		 783 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  33.73 
 
 		 779 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 		 822 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  33.42 
 
 		 889 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  33.79 
 
 		 897 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 		 771 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  31.03 
 
 		 911 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 1197 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1019 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.71 
 
 		 842 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1019 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 968 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.66 
 
 		 871 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  26.63 
 
 		 1048 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  30.72 
 
 		 875 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25.39 
 
 		 885 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.09 
 
 		 837 aa  197  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  26.4 
 
 		 822 aa  197  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  25.61 
 
 		 918 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 		 869 aa  195  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 		 862 aa  194  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  24.88 
 
 		 826 aa  187  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  24.38 
 
 		 891 aa  187  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  23.82 
 
 		 895 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  24.66 
 
 		 862 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  23.73 
 
 		 895 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 1041 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  28.71 
 
 		 690 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 895 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.25 
 
 		 1284 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  28.36 
 
 		 1207 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  24.54 
 
 		 920 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  23.95 
 
 		 851 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.21 
 
 		 895 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  23.91 
 
 		 975 aa  177  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.68 
 
 		 958 aa  177  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 853 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.92 
 
 		 853 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  22.67 
 
 		 886 aa  174  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  26.9 
 
 		 850 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  24.52 
 
 		 840 aa  171  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  24.82 
 
 		 1284 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  22.87 
 
 		 853 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 		 923 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  26.73 
 
 		 853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  23.87 
 
 		 933 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  26.69 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 841 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 841 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  22.71 
 
 		 901 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 838 aa  165  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.67 
 
 		 841 aa  165  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  23.22 
 
 		 843 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  23.57 
 
 		 845 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  25.19 
 
 		 952 aa  162  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  23.39 
 
 		 843 aa  161  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 671 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  25.12 
 
 		 889 aa  160  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 694 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 		 684 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.56 
 
 		 680 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.79 
 
 		 868 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 702 aa  157  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  23.43 
 
 		 843 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  25.8 
 
 		 680 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  27.56 
 
 		 680 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.27 
 
 		 1059 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  22.92 
 
 		 845 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 1063 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 892 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 1063 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  28.36 
 
 		 680 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.02 
 
 		 1063 aa  154  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.29 
 
 		 1057 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.22 
 
 		 1057 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  22.38 
 
 		 850 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.02 
 
 		 1074 aa  153  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 		 850 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 		 850 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  23.13 
 
 		 941 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  20.92 
 
 		 846 aa  150  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 		 693 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  23.9 
 
 		 912 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  26.24 
 
 		 688 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  23.25 
 
 		 924 aa  147  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  23.92 
 
 		 908 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 		 741 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 1007 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  26.24 
 
 		 808 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>