More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0805 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  92.84 
 
 		 900 aa  1461    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  93.47 
 
 		 832 aa  1466    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  56.71 
 
 		 787 aa  882    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  96.04 
 
 		 782 aa  1541    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  96.8 
 
 		 782 aa  1579    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 782 aa  1622    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  96.16 
 
 		 782 aa  1538    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  60.82 
 
 		 792 aa  922    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  94.12 
 
 		 782 aa  1537    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  67.8 
 
 		 835 aa  1066    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  42.03 
 
 		 783 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  40.64 
 
 		 822 aa  492  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  39.6 
 
 		 889 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  36.18 
 
 		 779 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  38.26 
 
 		 897 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  37.33 
 
 		 911 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  36.76 
 
 		 771 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  93.84 
 
 		 211 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  34.34 
 
 		 1197 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  92.9 
 
 		 170 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1019 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1019 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.55 
 
 		 842 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.75 
 
 		 968 aa  240  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  25.78 
 
 		 871 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  27.92 
 
 		 1284 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  24.97 
 
 		 869 aa  227  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  25.09 
 
 		 875 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  27.79 
 
 		 837 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  27.74 
 
 		 826 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  26.58 
 
 		 1284 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.85 
 
 		 885 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  26.26 
 
 		 822 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  26.37 
 
 		 690 aa  210  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.82 
 
 		 901 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.79 
 
 		 918 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.84 
 
 		 975 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  24.94 
 
 		 886 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.89 
 
 		 920 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.06 
 
 		 843 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  27.63 
 
 		 952 aa  205  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 845 aa  200  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.66 
 
 		 845 aa  190  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  26.57 
 
 		 850 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  26.57 
 
 		 850 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  26.57 
 
 		 850 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.06 
 
 		 853 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 		 1063 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 		 1063 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.9 
 
 		 1048 aa  187  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  24.18 
 
 		 846 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  24.94 
 
 		 1063 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 835 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  25.55 
 
 		 958 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  24.14 
 
 		 843 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  22.74 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  25.61 
 
 		 1059 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  25.31 
 
 		 1057 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  25.12 
 
 		 1057 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  25.85 
 
 		 924 aa  180  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.65 
 
 		 862 aa  180  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  24 
 
 		 843 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  23.39 
 
 		 923 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 		 941 aa  177  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  22.6 
 
 		 853 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 		 956 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 		 956 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  26.09 
 
 		 889 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  23.38 
 
 		 895 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  23.85 
 
 		 895 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  24.32 
 
 		 955 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 892 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  24.49 
 
 		 862 aa  174  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  23.52 
 
 		 852 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  26.46 
 
 		 838 aa  173  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  30.74 
 
 		 671 aa  173  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  23.85 
 
 		 895 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 1041 aa  171  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  24.8 
 
 		 898 aa  171  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  25.5 
 
 		 851 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  23.67 
 
 		 850 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.65 
 
 		 895 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  22.98 
 
 		 853 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  23.89 
 
 		 840 aa  168  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  23.51 
 
 		 910 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 		 1074 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  24.9 
 
 		 868 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  25.87 
 
 		 912 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 891 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  27.93 
 
 		 684 aa  164  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 841 aa  163  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 841 aa  163  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 933 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  28.46 
 
 		 763 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 841 aa  161  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 1207 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.17 
 
 		 680 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 		 1012 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  27.17 
 
 		 680 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  29 
 
 		 509 aa  157  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>