More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0179 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
783 aa  1624    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  42.31 
 
 
782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  41.92 
 
 
782 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  43.88 
 
 
835 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  42.03 
 
 
782 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  42.88 
 
 
832 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  41.9 
 
 
782 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  41.81 
 
 
782 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  41.82 
 
 
900 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  40.86 
 
 
787 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  37 
 
 
792 aa  502  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 
779 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 
897 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  32.28 
 
 
911 aa  349  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 
771 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  32.05 
 
 
889 aa  333  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 
1197 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 
822 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.27 
 
 
1019 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  26.88 
 
 
842 aa  234  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  26.71 
 
 
1019 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  27.16 
 
 
690 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  24.84 
 
 
853 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  23.1 
 
 
958 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 
956 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 
956 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  24.77 
 
 
975 aa  170  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 
843 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.24 
 
 
1284 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  23.86 
 
 
886 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.58 
 
 
955 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 
694 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.59 
 
 
822 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  26.78 
 
 
680 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  26.68 
 
 
702 aa  155  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  24.81 
 
 
1041 aa  154  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.45 
 
 
1048 aa  154  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  24.23 
 
 
901 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 
838 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  24.29 
 
 
920 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  27.41 
 
 
671 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.17 
 
 
680 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  24.9 
 
 
851 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 
869 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 
693 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  24.25 
 
 
837 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  26.97 
 
 
680 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  24.9 
 
 
845 aa  147  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  23.36 
 
 
895 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 
1207 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.43 
 
 
933 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  23.34 
 
 
911 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 
895 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  23.48 
 
 
895 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 
841 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  25.07 
 
 
826 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 
841 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  23.38 
 
 
1284 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 
680 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 
841 aa  144  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  28.6 
 
 
1007 aa  144  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
1007 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  26.73 
 
 
875 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  24.49 
 
 
845 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  23.87 
 
 
885 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 
684 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 
871 aa  142  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
1007 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
1007 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
1007 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
1007 aa  141  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  27.4 
 
 
725 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 
763 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
1007 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  30.25 
 
 
968 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  24.28 
 
 
862 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  23.21 
 
 
862 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  22.7 
 
 
843 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  26.96 
 
 
741 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  26.96 
 
 
741 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 
952 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  23.37 
 
 
846 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  23.27 
 
 
843 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  27.14 
 
 
740 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  27.89 
 
 
790 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  23.87 
 
 
918 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  26.96 
 
 
732 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 
740 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  24.67 
 
 
678 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  26.01 
 
 
741 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  23.6 
 
 
908 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  26.18 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  22.54 
 
 
850 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 
1012 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  24.22 
 
 
680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 
675 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  24.76 
 
 
840 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  22.72 
 
 
902 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  24.02 
 
 
889 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  23.72 
 
 
922 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>