More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3651 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 779 aa  1606    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  38.56 
 
 		 835 aa  492  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  38.66 
 
 		 897 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  37.21 
 
 		 782 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  37.74 
 
 		 832 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  38.9 
 
 		 889 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  36.18 
 
 		 782 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  37.23 
 
 		 787 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  37.33 
 
 		 900 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  36.92 
 
 		 911 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  36.18 
 
 		 782 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  36.51 
 
 		 782 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  35.84 
 
 		 782 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  36.03 
 
 		 822 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  36.47 
 
 		 771 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  33.73 
 
 		 792 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  35.06 
 
 		 1197 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 783 aa  389  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.68 
 
 		 853 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  25.66 
 
 		 871 aa  232  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.97 
 
 		 851 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  27.45 
 
 		 1041 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  25.6 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  27.89 
 
 		 690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  24.82 
 
 		 875 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  24.01 
 
 		 968 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 		 1207 aa  204  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  30.92 
 
 		 1007 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  30.92 
 
 		 1007 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.23 
 
 		 901 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  31.12 
 
 		 1007 aa  200  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  26 
 
 		 1048 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  30.72 
 
 		 1007 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  30.72 
 
 		 1007 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  30.72 
 
 		 1007 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  30.72 
 
 		 1007 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.44 
 
 		 837 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.3 
 
 		 975 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.81 
 
 		 886 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 885 aa  191  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  25.42 
 
 		 952 aa  191  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 911 aa  190  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 1012 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  25.78 
 
 		 918 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 		 924 aa  181  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.49 
 
 		 1284 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  24.19 
 
 		 842 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.54 
 
 		 862 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.15 
 
 		 822 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 671 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  24.54 
 
 		 862 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  24.06 
 
 		 843 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.57 
 
 		 843 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  25.38 
 
 		 1284 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.29 
 
 		 895 aa  172  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 		 906 aa  171  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  24.58 
 
 		 1059 aa  170  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  27.53 
 
 		 684 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  24.48 
 
 		 891 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1019 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  24.37 
 
 		 1063 aa  168  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  24.37 
 
 		 1063 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.29 
 
 		 680 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 895 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  26.4 
 
 		 790 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  23.95 
 
 		 1063 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  27.29 
 
 		 680 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  23.11 
 
 		 920 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  23.86 
 
 		 895 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 		 843 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 895 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1019 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  23.64 
 
 		 680 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  26.6 
 
 		 693 aa  157  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  24.19 
 
 		 910 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  25.15 
 
 		 808 aa  157  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 		 702 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  22.67 
 
 		 941 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  23.79 
 
 		 826 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  25.09 
 
 		 675 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  24.23 
 
 		 853 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  24.95 
 
 		 688 aa  154  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 694 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  26.95 
 
 		 680 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  22.39 
 
 		 845 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  22.21 
 
 		 845 aa  151  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  24.05 
 
 		 898 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  25.92 
 
 		 763 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 		 840 aa  148  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  27.44 
 
 		 725 aa  146  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 933 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  25.44 
 
 		 680 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  24.89 
 
 		 741 aa  144  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  25.46 
 
 		 619 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  24.89 
 
 		 741 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  26.74 
 
 		 740 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  24.53 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  25.73 
 
 		 641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  24.37 
 
 		 889 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  24.51 
 
 		 683 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>