More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3479 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  50.87 
 
 		 771 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  50.26 
 
 		 822 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  49.62 
 
 		 889 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  57.08 
 
 		 911 aa  1009    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 897 aa  1834    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  38.74 
 
 		 779 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  38.88 
 
 		 835 aa  475  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  37.78 
 
 		 832 aa  466  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  37.57 
 
 		 782 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  38.6 
 
 		 782 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  38.37 
 
 		 900 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  39.37 
 
 		 782 aa  458  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  37.99 
 
 		 782 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  39.23 
 
 		 782 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  38.61 
 
 		 787 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  36.12 
 
 		 1197 aa  406  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  33.93 
 
 		 792 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 		 783 aa  343  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  24.3 
 
 		 968 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 1074 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 923 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  24.83 
 
 		 1059 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.73 
 
 		 975 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  23.85 
 
 		 1063 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 1063 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 1063 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.02 
 
 		 871 aa  191  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  25.07 
 
 		 690 aa  190  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  23.79 
 
 		 1057 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  23.7 
 
 		 1057 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  24.62 
 
 		 1284 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  30.42 
 
 		 875 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  24.75 
 
 		 895 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  24.34 
 
 		 895 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1019 aa  181  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  26.29 
 
 		 837 aa  180  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  24.84 
 
 		 895 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 		 869 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  27.56 
 
 		 1041 aa  178  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.21 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.18 
 
 		 843 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  27.72 
 
 		 1207 aa  172  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  24.91 
 
 		 901 aa  172  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  23.24 
 
 		 892 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 918 aa  171  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.61 
 
 		 853 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  28.49 
 
 		 822 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  24.02 
 
 		 850 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.62 
 
 		 958 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  24.45 
 
 		 885 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  24.58 
 
 		 1284 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  24.41 
 
 		 843 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  25.1 
 
 		 1048 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  24.14 
 
 		 910 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  26.65 
 
 		 952 aa  162  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.3 
 
 		 851 aa  162  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  25.52 
 
 		 845 aa  161  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.91 
 
 		 853 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  29.61 
 
 		 1007 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  24.86 
 
 		 933 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  29.4 
 
 		 1007 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 		 862 aa  154  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 1007 aa  152  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 1007 aa  152  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.04 
 
 		 853 aa  152  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 1007 aa  152  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  29.19 
 
 		 1007 aa  152  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  26.97 
 
 		 853 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  28.78 
 
 		 1007 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 		 891 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  23.84 
 
 		 845 aa  149  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 841 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1019 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.13 
 
 		 895 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 		 1012 aa  148  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  24.45 
 
 		 841 aa  148  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  23.1 
 
 		 826 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  26.41 
 
 		 924 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  24.25 
 
 		 850 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  24.28 
 
 		 862 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.75 
 
 		 868 aa  145  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 850 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 850 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  24.22 
 
 		 841 aa  144  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  23.53 
 
 		 920 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  24.78 
 
 		 898 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.67 
 
 		 843 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  24 
 
 		 911 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  23.26 
 
 		 741 aa  141  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  23.53 
 
 		 741 aa  141  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  40.78 
 
 		 211 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  24.63 
 
 		 956 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  24.63 
 
 		 956 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  22.65 
 
 		 846 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.3 
 
 		 838 aa  137  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  29.95 
 
 		 835 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  22.75 
 
 		 941 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  26.07 
 
 		 697 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.6 
 
 		 842 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  25.22 
 
 		 852 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>