More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3130 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  67.8 
 
 		 782 aa  1059    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  55.61 
 
 		 787 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  68.71 
 
 		 782 aa  1071    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  68.53 
 
 		 782 aa  1058    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 835 aa  1729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  64.58 
 
 		 900 aa  1082    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  68.84 
 
 		 782 aa  1077    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  66.59 
 
 		 832 aa  1116    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  69.45 
 
 		 782 aa  1085    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  55.85 
 
 		 792 aa  859    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  43.88 
 
 		 783 aa  591  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  38.56 
 
 		 779 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  38.37 
 
 		 822 aa  482  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  38.88 
 
 		 897 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  38.92 
 
 		 889 aa  446  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  36.46 
 
 		 911 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  36.64 
 
 		 771 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  35.26 
 
 		 1197 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1019 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1019 aa  274  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  64.53 
 
 		 211 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 968 aa  266  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.61 
 
 		 842 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  27.25 
 
 		 886 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 		 1284 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.96 
 
 		 885 aa  230  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.95 
 
 		 975 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  25.63 
 
 		 1284 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.24 
 
 		 901 aa  224  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  26.55 
 
 		 690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  65.64 
 
 		 170 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  27.02 
 
 		 924 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  25.45 
 
 		 911 aa  212  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  26.81 
 
 		 822 aa  211  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  33.49 
 
 		 871 aa  207  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.15 
 
 		 918 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  27.32 
 
 		 952 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  24.19 
 
 		 895 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  24.87 
 
 		 846 aa  201  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  24.34 
 
 		 958 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  26.9 
 
 		 837 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  23.96 
 
 		 895 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.8 
 
 		 920 aa  196  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  31.05 
 
 		 875 aa  196  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  23.96 
 
 		 895 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.6 
 
 		 869 aa  195  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  25.03 
 
 		 853 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  25.11 
 
 		 826 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 956 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 956 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.75 
 
 		 838 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  24.82 
 
 		 955 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 841 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.92 
 
 		 1048 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 841 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  29.8 
 
 		 841 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  26.01 
 
 		 843 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 		 851 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  27.9 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  24.91 
 
 		 1063 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  24.93 
 
 		 1057 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  24.91 
 
 		 1063 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 		 843 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  23.53 
 
 		 941 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  24.97 
 
 		 910 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  24.55 
 
 		 1057 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  24.22 
 
 		 1059 aa  179  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  25.06 
 
 		 1063 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 845 aa  178  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.61 
 
 		 680 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  29.73 
 
 		 688 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  30.43 
 
 		 671 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  24.01 
 
 		 845 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  28.22 
 
 		 680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  29.73 
 
 		 808 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  29.55 
 
 		 1074 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  24.34 
 
 		 898 aa  172  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  25.56 
 
 		 912 aa  171  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 843 aa  171  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 895 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 		 840 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  27.43 
 
 		 1041 aa  170  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 		 1012 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 891 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 694 aa  168  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 693 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  28.81 
 
 		 790 aa  168  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 933 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 680 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.13 
 
 		 862 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 		 850 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 		 850 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  26.55 
 
 		 889 aa  164  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 1207 aa  164  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.95 
 
 		 850 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 1007 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 923 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 		 868 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.23 
 
 		 892 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>