144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0164 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  93.84 
 
 		 782 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  94.79 
 
 		 782 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  93.84 
 
 		 782 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  91.47 
 
 		 782 aa  387  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  85.31 
 
 		 782 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  89.85 
 
 		 832 aa  351  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  88.32 
 
 		 900 aa  344  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  94.67 
 
 		 170 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  64.53 
 
 		 835 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  55.05 
 
 		 787 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2501  hypothetical protein  87.21 
 
 		 86 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  45.11 
 
 		 822 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  40.78 
 
 		 897 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  41.52 
 
 		 911 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  44.69 
 
 		 889 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  33 
 
 		 779 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 		 783 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  30.84 
 
 		 952 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  33.13 
 
 		 1063 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  33.13 
 
 		 1063 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  33.13 
 
 		 1063 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  32.53 
 
 		 1057 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 1074 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  31.82 
 
 		 924 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  32 
 
 		 843 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  32.53 
 
 		 1057 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 850 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  33.56 
 
 		 1284 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 850 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  31.33 
 
 		 1059 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  32.5 
 
 		 850 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  35.82 
 
 		 835 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  32.59 
 
 		 843 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.44 
 
 		 1284 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  31.65 
 
 		 875 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  31.5 
 
 		 957 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  31.21 
 
 		 852 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  29.86 
 
 		 771 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  35.04 
 
 		 871 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.37 
 
 		 895 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  32.61 
 
 		 837 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 		 869 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 895 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 895 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.14 
 
 		 868 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1019 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1019 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  30.77 
 
 		 822 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  32.1 
 
 		 792 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.63 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  30.06 
 
 		 910 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.19 
 
 		 842 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  29.24 
 
 		 941 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  32.89 
 
 		 826 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  35.07 
 
 		 885 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 		 912 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  28.84 
 
 		 865 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  32.56 
 
 		 892 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 853 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 		 846 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 850 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 923 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.95 
 
 		 895 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  23.16 
 
 		 920 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 		 891 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  26.92 
 
 		 853 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  26.98 
 
 		 907 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 845 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  30.24 
 
 		 1197 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 		 958 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  28.85 
 
 		 845 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  27.44 
 
 		 885 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  33.56 
 
 		 918 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 		 843 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  34.85 
 
 		 911 aa  74.7  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 		 968 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0014  hypothetical protein  32.52 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.515774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  34.59 
 
 		 895 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  32.82 
 
 		 612 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.73 
 
 		 847 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  22.89 
 
 		 928 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1111 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  31.54 
 
 		 1111 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 1111 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 1111 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  29.23 
 
 		 1114 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  25.33 
 
 		 780 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  24.88 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  23.23 
 
 		 961 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  24.67 
 
 		 780 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 902 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  25.95 
 
 		 932 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  24.29 
 
 		 912 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  24.12 
 
 		 901 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  25.82 
 
 		 898 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 		 811 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  24.84 
 
 		 935 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 		 1094 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>