More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6319 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 1197 aa  2486    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  38.9 
 
 		 771 aa  502  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 		 889 aa  495  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  39.21 
 
 		 822 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 		 911 aa  465  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  35.06 
 
 		 779 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 897 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  35.98 
 
 		 787 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  35.38 
 
 		 782 aa  416  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  35.26 
 
 		 835 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  34.58 
 
 		 832 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  33.59 
 
 		 900 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  34.3 
 
 		 782 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  34.12 
 
 		 782 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  33.99 
 
 		 782 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 782 aa  393  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 792 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 		 783 aa  347  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  27.82 
 
 		 886 aa  207  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.78 
 
 		 975 aa  202  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.67 
 
 		 901 aa  199  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.13 
 
 		 853 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  25.16 
 
 		 968 aa  188  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  25.26 
 
 		 842 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1019 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.09 
 
 		 851 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1019 aa  184  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  31.59 
 
 		 690 aa  183  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.99 
 
 		 822 aa  178  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 885 aa  177  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  24.66 
 
 		 837 aa  173  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.31 
 
 		 843 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  23.58 
 
 		 869 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  23.83 
 
 		 958 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 1284 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  24.87 
 
 		 952 aa  161  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  24.6 
 
 		 843 aa  158  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  23.94 
 
 		 920 aa  157  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  23.95 
 
 		 843 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 1041 aa  153  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.84 
 
 		 910 aa  151  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  22.13 
 
 		 838 aa  151  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.6 
 
 		 871 aa  150  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  25.21 
 
 		 1284 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  24.37 
 
 		 911 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  23.34 
 
 		 852 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 		 1007 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 		 1007 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 912 aa  148  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  25.63 
 
 		 1207 aa  147  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 		 1007 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  23.81 
 
 		 845 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  21.9 
 
 		 846 aa  146  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  26.27 
 
 		 956 aa  147  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  26.27 
 
 		 956 aa  147  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 1007 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 1007 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 1007 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 1007 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 875 aa  146  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  22.48 
 
 		 841 aa  145  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  22.48 
 
 		 841 aa  145  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  24.17 
 
 		 840 aa  145  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 		 922 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  22.14 
 
 		 1048 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.39 
 
 		 955 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  27.86 
 
 		 680 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 1012 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  23.96 
 
 		 841 aa  141  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  25.64 
 
 		 921 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  24.19 
 
 		 850 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 		 928 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  22.7 
 
 		 941 aa  140  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 933 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 		 928 aa  138  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  23.61 
 
 		 924 aa  137  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  22.42 
 
 		 845 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  23.71 
 
 		 889 aa  136  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 926 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  24.62 
 
 		 826 aa  135  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  24.03 
 
 		 902 aa  134  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  28.02 
 
 		 850 aa  134  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  28.02 
 
 		 850 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  28.02 
 
 		 850 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  22.31 
 
 		 862 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.19 
 
 		 835 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  29.98 
 
 		 922 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  25.58 
 
 		 898 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  24.9 
 
 		 926 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  24.9 
 
 		 926 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  22.58 
 
 		 862 aa  129  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  23.13 
 
 		 923 aa  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  23.21 
 
 		 853 aa  125  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  25.33 
 
 		 927 aa  125  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  25.86 
 
 		 853 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  25.52 
 
 		 858 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 892 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  27.76 
 
 		 763 aa  119  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>