More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0863 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  89.79 
 
 
1007 aa  1806    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  89.99 
 
 
1007 aa  1814    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  89.99 
 
 
1007 aa  1814    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  90.09 
 
 
1007 aa  1814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  90.09 
 
 
1007 aa  1814    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
1012 aa  2063    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  89.99 
 
 
1007 aa  1814    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  89.99 
 
 
1007 aa  1814    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 
1041 aa  266  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
1207 aa  258  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  29.63 
 
 
690 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  31.52 
 
 
645 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
779 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  28.94 
 
 
693 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  26.71 
 
 
741 aa  184  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  30.19 
 
 
780 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  28.91 
 
 
671 aa  180  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  24.85 
 
 
709 aa  180  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  26.4 
 
 
741 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  32.27 
 
 
901 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  28.63 
 
 
683 aa  178  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  28.76 
 
 
683 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  27.5 
 
 
646 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  29.23 
 
 
616 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 
741 aa  173  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 
694 aa  172  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  31.76 
 
 
886 aa  172  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  26.85 
 
 
835 aa  171  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 
968 aa  171  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 
661 aa  171  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  30.3 
 
 
975 aa  171  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  28.6 
 
 
741 aa  171  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  28.6 
 
 
741 aa  170  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 
702 aa  170  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  26.61 
 
 
643 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  28.12 
 
 
689 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 
675 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 
889 aa  168  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  28.26 
 
 
689 aa  168  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 
911 aa  167  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  29.81 
 
 
680 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  26.95 
 
 
697 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  28.6 
 
 
782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  28.6 
 
 
782 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  29.6 
 
 
680 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
832 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 
694 aa  163  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  28.99 
 
 
668 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 
661 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 
699 aa  163  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 
661 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  29.35 
 
 
790 aa  163  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 
661 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 
680 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 
661 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 
661 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  24.21 
 
 
661 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  29.23 
 
 
778 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  23.92 
 
 
661 aa  161  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  30.17 
 
 
792 aa  160  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  28.36 
 
 
822 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 
655 aa  160  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 
838 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  28.66 
 
 
841 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 
900 aa  158  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 
680 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  28.46 
 
 
668 aa  157  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 
703 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 
680 aa  156  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 
641 aa  155  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  26.57 
 
 
763 aa  155  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 
841 aa  155  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 
853 aa  155  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 
841 aa  155  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  26.04 
 
 
684 aa  155  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 
741 aa  155  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 
782 aa  155  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  29.35 
 
 
794 aa  155  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  26.87 
 
 
796 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  27.91 
 
 
687 aa  154  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  26.47 
 
 
767 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  28.53 
 
 
668 aa  154  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  27.36 
 
 
787 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  28.3 
 
 
808 aa  154  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 
777 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 
669 aa  151  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 
767 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  29.48 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  27.31 
 
 
732 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 
782 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  28.83 
 
 
725 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  27.27 
 
 
1095 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  28.09 
 
 
688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  27.65 
 
 
753 aa  149  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  29.13 
 
 
907 aa  149  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  29.13 
 
 
774 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 
782 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 
788 aa  148  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  27.93 
 
 
769 aa  147  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>